(六)蛋白质的加工转运降解
第九章 蛋白质的加工、易位及降解 1 蛋白质的加工 2 蛋白质易位 3 蛋白质的降解 4 小 结 1.1 N端fMet或Met切除1.2 二硫键形成1.3 特定氨基酸化学修饰1.4 新生肽链中非功能片段切除 细菌蛋白质N端甲酰基能被甲酰化酶水解。 不管原核生物或真核生物,N端Met常在肽链合成完前被切除。 有些病毒mRNA可翻译成很长多肽链,经蛋白酶水解后得到几个功能蛋白质分子。 2 蛋白质易位 2.1 概 述 2.2 共翻译易位 2.3 翻译后易位 2.4 细菌蛋白质易位 2.5 分子伴侣 2.1 概 述 细胞中蛋白质合成:绝大多数在细胞质中合成;小一部分在细胞器(叶绿体和线粒体)中合成。 定位于细胞器内的大部分在细胞质中合成,细胞器内合成的留在细胞器内。 蛋白质插入或穿过生物膜的过程称为蛋白质易位(protein translocation)。 蛋白质易位的两种方式 共翻译易位 co-translational translocation ◆是即将进入内质网的蛋白质的易位方式; ◆蛋白质正合成的时候就可与易位装置结合; ◆结果使核糖体定位于内质网表面,称膜结合核糖体(membrane-bound ribosome)。 ◆蛋白质翻译完成后从核糖体上释放,然合扩散至合适靶膜并与易位装置结合。 ◆蛋白质合成时,其核糖体不与任何细胞器相连,称游离核糖体(free ribosome) 2.2 共翻译易位 2.2.1 信号肽假说 2.2.2 信号肽及其特性 2.2.3 信号肽与蛋白质转运的关系 2.2.4 蛋白质共翻译易位的基本过程 2.2.1 信号肽假说 共翻译定位蛋白质定位信息存在于该蛋白质自身结构中(信号肽),并可通过与特殊受体相互作用,使蛋白质定位于靶位。 信号肽 (signal peptide): 能启动蛋白质运转的任何一段多肽。 绝大部分被运入内质网内腔蛋白质都带有一个信号肽。 信号肽结构特点: (1)常位于蛋白质N末端,可切割; (2)长度:15 - 30个残基; (3)序列内有一个全部或大部分疏水组成的疏水核心; (4)靠近该序列 N 端常有几个正电荷氨基酸; (5)其C-末端靠近切割处常带数个极性氨基酸,离切割点最近那个氨基酸常带很短侧链(Ala或Gly ) 2.2.3 信号肽与蛋白质转运的关系 (1)完整信号肽是保证蛋白质转运的必要条件; (2)仅有信号肽不足以保证蛋白质转运发生; (3)信号序列切除并不是转运所必需; (4)并非所有运转蛋白质都有可降解的信号肽。 蛋白质共翻译易位可分两个阶段: 首先:带有新生肽链的核糖体与膜结合; 然合:新生肽链进入膜通道并易位。 核糖体与膜结合需要信号识别颗粒(signal recognition particle, SRP)。SRP有两种能力: ◆结合新合成的分泌型蛋白的信号序列; ◆可和位于膜上的 SRP 受体结合。 2.3 翻译后易位 2.3.1 前导肽及其特性 2.3.2 蛋白质穿越不同器膜的过程 2.3.1 前导肽及其特性 翻译后跨膜易位的蛋白质,前体一般含前导肽(leader peptide),前导肽在跨膜运转中起重要作用。 过膜后,前导肽水解,蛋白质变为有功能的蛋白质。 (1)带正电荷碱性氨基酸(Arg)较丰富, 分散于不带电荷的氨基酸序列之间; (2)缺少带负电荷的酸性氨基酸; (3)羟基氨基酸(Ser)含量较高; (4)有形成两亲(亲水和疏水)α- 螺旋能力。 任何蛋白过膜须解决一个问题:蛋白质表面常是亲水性的,而生物膜是疏水性的。因此必须在膜上构建特殊的通道才能使蛋白质穿过膜。 (1)穿越内质网(endoplasmic reticulum) 、线粒体(mitochondria)及叶绿体 (chloroplast) 膜 膜上含有镶嵌于膜的蛋白质样结构,它可以使蛋白质不与疏水性的类脂分子接触而穿过膜。 (2)穿越过氧化物酶体膜 (peroxisome) 膜上也有类似的装置,但底物蛋白质并不直接与其结合。需载体蛋白协助穿过膜。 (3)穿越细胞核膜 向核内转运需更大更复杂的装置,即核孔(nuclear pore )。由载体蛋白与底物结合并进行跨核孔转运 细菌蛋白通过共翻译或翻译后可被定位于细胞膜或细胞周质空间,或被分泌出去。 2.5 分子伴侣 (chaperone) 2.5.1 定 义 2.5.2 生物学功能 2.5.1 定 义 分子伴侣:结合在一些不完全装配
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