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- 2016-05-07 发布于河南
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附录 Using XSHELL 对于具有确定立体结构的有机基团,可采用理论加氢;对于无法理论加氢的,如水分子,可从差值Fourier图中找出氢原子,参加精修的情况视 数据的质量而定 C 计算/指认并精修氢原子 理论加氢的方法 退出XSHELL,在Edit-.ins文件的命令区,添加指令: HFIX mn 需加氢原子名(产生AFIX固定) m 是一或两位数,指定氢的类型: =1 叔-H, =2 仲-H, =3(或13) 伯-H, =4 芳-H, =8(或14) X-O-H, =9 X=CH2或X-NH2, =15 笼状B-H n 是一位数,指定固定的类型: =1 坐标、占有率、位移因子固定, =2 占有率、位移因子固定, =3(或7) 坐标固定, =4 同3,但允许修正X-H的键长(方向固定) 然后进行XL精修,完成后进入XSHELL继续精修 也可在XSHELL中先点Atoms-Hybridize All 再点Atoms-Calculate Hydrogens 然后检查H加的是否合理,如不合理,可打开Edit-Edit Current File修改不合理的部分,再用Refine继续精修 还可在XSHELL中先
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