制生物化学与分子生物学遗传信息传递的整体性资料讲解.ppt

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(一)CGAP提供了解码肿瘤相关基因 所需的信息和技术工具 CGAP包括5个部分: 人类肿瘤基因索引(hTGI)指明了在人类肿瘤发生过程中的基因表达; 分子表达谱(MP)展示了以前列腺为例从分子水平分析人类组织样品的概念; 癌症染色体变异计划(CCAP)描述了与恶性转移相关的染色体改变; 遗传注解索引(GAI)指明和描绘了与癌症相关的多态性; 小鼠肿瘤基因索引(mTGI)确定了在小鼠肿瘤发生过程中的基因表达(/)。 (二)CGAP的目标是建立肿瘤细胞基因表达数据库和完整的基因及其变异目录 CGAP 的第一个目标是建立各种不同类型肿瘤的正常、癌前病变、癌细胞基因表达数据库,为肿瘤研究者描绘出完整的肿瘤细胞分子特征。(/SAGE) CGAP的另一目标是建立一套完整的基因及其变异目录,不仅有利于评价癌症的危险程度,而且可以根据遗传变化确定预防或治疗策略,最终根据分子特征达到治疗的目的。 (三)癌症染色体畸变计划是CGAP的 另一个任务 染色体畸变包括结构变异和数目变异等 鉴定染色体畸变有利于 对肿瘤进行诊断、分类和选择性治疗 可以与某种肿瘤进行连锁或关联分析,进而定位克隆肿瘤相关基因 染色体畸变人基因组BAC 克隆库(/Chromosomes/CCAP) 代谢组学(metabonomics) 测定一个生物/细胞中所有小分子(Mr?1 000 )组成,描绘其动态变化规律,建立系统代谢图谱,并确定这些变化与生物过程的联系。 四、代谢组学研究内源性代谢物质的 动态变化规律及与生物过程的联系 代谢组学分为4个层次: ①代谢物靶标分析(metabolite target analysis) ②代谢谱分析(metabolic profiling analysis) ③代谢组学 ④代谢指纹分析(metabolic fingerprinting analysis) 代谢组学研究对象: 生物体液——血样、尿样等 完整的组织样品、组织提取液和细胞培养液 (一)代谢组学的任务是分析生物/细胞 代谢产物的全貌 主要的分析工具 ①核磁共振(nuclear magnetic resonance,NMR):氢谱(1H-NMR)、碳谱(13C-NMR)及磷谱(31P-NMR)。 ②MS:MS按质荷比(m/z)进行各种代谢物的定性或定量分析,可得到相应的代谢产物谱。 ③色谱及联用技术:使样品的分离、定性、定量一次完成,具有较高的灵敏度和选择性。 (二)核磁共振、色谱及MS是代谢组学的主要分析工具 代谢组学研究侧重于代谢物的组成、特性与变化规律,与生理学的联系更加紧密。 疾病→机体病理生理过程变化→代谢产物的改变→比较分析与正常人的代谢产物差异→发现和筛选出疾病新的生物标记物→对相关疾病作出早期预警→发展新的有效的疾病诊断方法。 药物代谢组学的研究,可阐明药物在不同个体体内的代谢途径及其规律,将为合理用药和个体化医疗提供重要依据。 (三)代谢组学是开展预测医学和个体化 医学的重要手段 小 结 生物遗传信息传递具有方向性和整体性的特点。 “组学”从整合的角度检视遗传信息的整体性,以解释生命科学的根本问题。 基因组学是阐明整个基因组结构、结构与功能的关系以及基因之间相互作用的科学。包括结构基因组学、功能基因组学和比较基因组学。 转录组学在整体水平上研究细胞编码基因转录情况及转录调控规律,研究对象即细胞所能转录出来的可直接参与蛋白质翻译的mRNA总和。 蛋白质组学以细胞、组织或机体在特定时间和空间上表达的所有蛋白质为研究对象,分析细胞内动态变化的蛋白质组成、表达水平与修饰状态,揭示蛋白质之间的相互作用及其调控规律。 药物基因组学以药物效应及安全性为目标,研究各种基因突变与药效及安全性的关系,药物基因组使药物治疗模式由诊断定向治疗转为基因定向治疗。 癌症基因组解剖计划将建立人类肿瘤细胞表达基因索引,为肿瘤的诊断、治疗带来新的希望。 代谢组学研究内源性代谢物质的组成、动态变化规律以及与生物过程的联系,代谢组学是基因组学和蛋白质组学的有力补充。 人有了知识,就会具备各种分析能力, 明辨是非的能力。 所以我们要勤恳读书,广泛阅读, 古人说“书中自有黄金屋。 ”通过阅读科技书籍,我们能丰富知识, 培养逻辑思维能力; 通过阅读文学作品,我们能提高文学鉴赏水平, 培养文学情趣; 通过阅读报刊,我们能增长见识,扩大自己的知识面。 有许多书籍还能培养我们的道德情操, 给我们巨大的精神力量, 鼓舞我们前进。 * (二)SAGE和MPSS分析可鉴定未知/新基因表达信息 基因表达系列分析(serial analysis of gene expression,SAGE)和大规模平行信号测序系统(massively parallel signature seq

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