利用生物信息学方法对基质细胞衍生因子（SDF）进行基因序列和蛋白质序列分析设计.docVIP

前 言 动 动脉粥样硬化（Atherosclerosis，As）是由多因素所致的血管炎症性疾病，其病变特点之一是动脉粥样硬化斑块部位有炎症细胞的浸润，巨噬细胞源性泡沫细胞是动脉粥样硬化早期的重要事件。实验报道，动脉粥样硬化病变部位的趋化因子趋化因子是由不同类型的细胞分泌的低分子量（8-10KD） 的。到目前为止已发现50多种，按照NH2-半胱氨酸基序的不同，可将趋化因子分为4个亚家族，即C、CC、CXC和CX3C。趋化因子受体是GPCR（G-protein-coupled receptors）超家族成员，是一族与G蛋白的、具有7个疏水的跨膜结构的受体。它广泛表达于各类淋巴细胞、内皮细胞、神经元等。趋化因子趋化因子动脉粥样硬化的: ①用最大相似的同源基因的功能注释咨询序列; ②用模体(MOTIF) 搜索,因为模体往往是功能相关的保守序列; ③直系同源簇方法 (cluster of orthologous group， COG)，即用不同种族的基因成对相似聚类法把它们划分成各种直系同源簇，从而可以用同一簇中的已知基因注释未知基因。同时结构基因组的研究使得三维结构模建和结构类的识别成为基因组功能注释的一个重要方面[13]。 我们选择该序列进行研究。从核酸和蛋白质两个方面对SDF-1α进行详尽的生物信息学分析。核酸分析方面主要分析其核酸序列的基本性质，如限制性酶切位点，基因组在