海岛棉EST-SSR引物遗传评价及海陆棉种间高密度遗传连锁图谱构建和QTL定位.pdf

摘要 L．)是世界上最重要的经济作物之一，为我们提供了天然的纺织 棉花(Gossypium 纤维和食用油，随着高效快速的纺纱技术的引进与普及，以及人民群众对衣着要求 的普遍提高，对我国棉花品种的总体纤维品质提出了更高的要求，但是常规育种方 法要求育种群体大，时间长，难度也较大，很难打破强度与产量之间的负相关，取 得突破性进展。 随着基因组研究的飞速发展，分子育种成为棉花纤维品质遗传改良的重要途径。 新的分子标记不断被开发并用于棉花高度整合的遗传图谱的构建，棉纤维基因结构 和功能的研究，棉纤维品质数量性状位点的定位及分子标记辅助选择(MAS)。 1．海岛棉EST-SSR引物的开发与应用研究 植物EST(expressedsequencetags)计划作为植物基因组计划的一个重要组成 部分，已经在多种物种中开展起来，EST资源库的不断扩充为采集SSR提供了海量 数据。现有的棉花EST-SSR引物大都开发于中棉、雷蒙德氏棉和陆地棉，尚没有海 岛棉的EST-SSR开发研究。众所周知，海岛棉是最重要的棉种之一，从中可以发掘 新的遗传材料用于陆地棉的纤维品质改良。 EST-SSR引物的特征，而且评价了其在物种间的可转移性，在遗传多样性分析及遗 传连锁图构建方面的应用价值。 材料(13份A基因组二倍体材料，11份D基因组二倍体材料和12份AD基因组异 313条多态性条带，平均每对引物产生4．11条。在二倍体棉种中的扩增效率从78．95％ 1．84％，与在 褐棉)到100％(达尔文棉)。在二倍体棉种中棉的扩增多态性率为1 四倍体棉种陆地棉的扩增多态性率相同。引物的多态性信息含量(PIC)变化于 聚类分析，聚类结果为三大类，分别为A基因组材料，D基因组材料和AD基因组 材料。此外，有2】对引物在本实验室的种间回交群体【(鄂棉22×Pima3．79)×鄂棉 22】DNA．中表现多态性扩增，产生24个多态性位点，其中22个被锚定于该遗传连 锁图的12条染色体。 这批新的EST-SSR引物在遗传多样性分析，比较作图和分子标记辅助选择 (MAS)育种的研究中具有较高的应用价值。 2．海陆棉种间BCl群体的高密度遗传连锁图谱构建与QTL定位 对棉花来说，以分子标记为铺垫的基础研究和应用研究才刚刚处于起步阶段， 关于棉花分子标记遗传连锁图谱和数量性状位点定位的研究仍需大量积累。以简单、 可靠、适于高通量分析的分子标记构建高密度的棉花遗传连锁图谱，将不断增多的 基因组信息剖析到相应的染色体片段上，才能使分子标记辅助选择育种、重要数量 性状基因的图位克隆等后续的研究得到顺利开展。在众多的分子标记中，SSR标记 具有分布广泛、位点特异性、共显性、信息量高等优点，是构建棉花遗传连锁图谱 最有优势的标记。 连锁图谱，并且以此图谱为基础，运用复合区间作图法进行纤维品质的QTL检测。 cM， 传连锁图谱，917个标记位点进入44个连锁群(26条染色体)，图谱全长5452．2 标记间的平均距离为5．9cM。位于连锁图上的偏分离标记共有107个，有72．9％标 了11个、20个、23个。 对本研究所用2596对EST-SSR引物的重复基序信息及其多态性表现进行统计 分析。结果表明：四核苷酸基序的多态性率(11．33％)高于二核苷酸基序的多态性 率(7．90％)及三核苷酸基序的多念性率(6．72％)，五核苷酸与六核苷酸的多态性 II 33bp和24bp的引物与其他引物相比，有着更大的产生多态性的潜力。以上结果将 对今后EST-SSR引物的设计提供参考价值。 起增效作用的QTL有3个，加性效应值在0．33到1．10之间。 关键词：棉花，EST-SSR，遗传多样性，遗传连锁图，QTL定位，纤维品质 Ⅱl Abstract L1 isoneofthemost economicthat Cotton(Gossypium important cropsprovide