多肽结构和保留时间关系研析.pdfVIP

摘要 摘要 随着仪器和分析技术快速发展，蛋白质组学有了新的进展，并成为最重要的 生命科学领域之一，其实验数据庞大，要求高通量计算来提高多肽鉴定得分， 从而提高蛋白鉴定准确度。而液相色谱中多肽的保留时间信息始终没有得到很 好的利用，保留时间是色谱分析中重要的参数，如果能够更好地利用此参数可 以提高多肽鉴定质量，从而提高蛋白质的鉴定可靠性。本文试图利用这些信息 抓住多肽保留行为的特点，运用化学计量学，化学信息学中常用的方法PLS， KPLS，SVR等建立多肽保留时间的QSAR模型，提高多肽鉴定质量，从而提高 蛋白质鉴定的数量和质量。 本文研究的对象多肽与其他化合物不同，多肽是由20种氨基酸组成，反映 它们结构的数据目前并没有直接显示，许多学者都是假设多肽的各种物化性质 是通过组成它们的氨基酸的性质加和来反映的。本文以文献中搜集到的3个数 据集为研究对象逐级深入地研究多肽结构和保留时间的关系，并提出了变量优 化的方法和新的局部变量，创造性地以局部变量结合全局变量建立QSAR模型， 为QSAR的研究开辟了新的研究方向，并建立了共识模型，得到0．96以上的相 关性系数，远远高于文献值。 具体研究步骤如下：首先大