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生物技术通报
# # 2006
BIOTECHN OLOG Y B ULLETIN
1 1 1 1 2 1 1 1
业艳芬 李成云 杨静 王云月 李进斌 刘林 苏源 朱有勇
1
( , 650201;
2, 650205)
: 结合计算机技术和生物信息 的方法, 采用组合的信号肽分析软件 SignalP v3. 0TargetP v1. 1Big-
PIpredictorT H v2. 0和 SecretomeP对已公布的 1486 个稻瘟菌(magnap orthe grisea)小蛋白基因的 N-端氨基酸
序列进行信号肽分析, 同时系统分析了信号肽的类型及结构分析结果表明, 在 1 486 个稻瘟病菌小蛋白中, 119
个具有 N-端信号肽的典型分泌蛋白其中 116 个具有分泌型信号肽, 1 个具 RR-motif型信号肽, 2 个具信号肽酶 II
型信号肽在稻瘟病菌基因组中,分泌型小蛋白的序列是高度趋异的, 仅出现少数氨基酸组成完全一致的信 号肽,
为进一步确认具有相同信号肽的分泌蛋白是否具有同源性,分别用 BLAST 2 SEQUENCES 对具有相同信号肽的分
泌蛋白进行了序列对比结果表明, 具有相同信号肽的分泌蛋白同源性非常高同时还采用 Subloc v1. 0对 1 486
个小蛋白的亚细胞位置进行了预测,结果显示小蛋白的可能功能场所包括细胞质细胞外线立体和细胞核, 功能
场所位于细胞核的小蛋白是最多的
: 稻瘟病菌 小蛋白 信号肽 分泌
Com putational Analysis of Signal-Peptide-Containing Small
Proteins inM agnap orthe Grisea
1 1 1 1
YeYanfen LiChengyun Yang Jing W angYunyue
2 1 1 1
Li Jinbin Liu Lin SuYuan ZhuYouyong
1
( TheM inistry of Educa tion K ey Laboratory f orAgriculturalB iod iversity
For P estManagem en,t unnan Agriculatural University, K unm ing
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