苋菜IRT1基因克隆、序列及其表达分析.pdfVIP

苋菜IRT1基因克隆、序列及其表达分析.pdf

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生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期 2012 2 苋菜 IRT1 基因克隆、序列及表达分析 孙静文 赵世诚 范洪黎 周卫 (中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 农业部作物营养与施肥重点开放实验室,北京 100081) 摘 要 : 通过对镉超积累苋菜品种天星米铁转运蛋白基因(IRT1 )的克隆、序列及表达分析,旨在为植物修复镉污染土壤 奠定基础。依据同源克隆原理,通过 RACE 技术克隆苋菜 IRT1 基因及生物信息学方法分析基因序列结构和功能,Northern 杂交研 究基因表达。苋菜 IRT1 基因 cDNA 全长 1 135 bp,包含完整的阅读框,编码 322 个氨基酸。苋菜 IRT1 蛋白与已知铁转运蛋白相 似性在 53.70%-63.04% ,具有铁转运蛋白典型的功能结构特征,即 N 端含有 1 个信号肽、氨基酸序列上具有完整的 ZIP 家族功能 结构域(Pfam: Zip )和7 个跨膜结构域(TMs )。苋菜 IRT1 蛋白还具有 1 个 COGO428 超级家族(转运二价金属离子功能)、2个蛋 白激酶C磷酸化位点和2个酪蛋白II 磷酸化位点。低铁胁迫时苋菜根中 IRT1 基因表达量增加 , 加镉处理没有改变 IRT1 基因表达量。 因此,推断苋菜 IRT1 基因是 ZIP 家族的一员,具有转运二价金属离子功能,将基因在 GenBank 中注册,序列号为 :GU363501 , 命名为 AmIRT1 。 关键词 : 苋菜 铁转运蛋白 克隆 基因表达 IRT1 基因 Cloning, Sequence and Expression Analysis of the IRT1 Gene in Amaranthus mangostanus L. Sun Jingwen Zhao Shicheng Fan Hongli Zhou Wei ( , Ministry of Agriculture Key Laboratory of Crop Nutrition and Fertilization Institute of Agricultural Resource and , , 100081 ) Regional Planning CAAS Beijing Abstract: To contribute to the development of the phytoremediation removing Cd from the soil, IRT1 gene was cloned according to homologous gene conserved region by RACE method from Amaranthus mangostanus L., a typical Cd hyperaccumulator named Tianxin

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