西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析.pdfVIP

园艺学报，2016 ，43 (2) ：281 –294. Acta Horticulturae Sinica doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0886；http ：//www. ahs. ac. cn 281 西瓜 bHLH 转录因子家族基因的鉴定及其在非 生物胁迫下的表达分析 何 洁，顾秀容，魏春华，杨小振，李 好，马建祥，张 勇，杨建强， 张 显* （西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌 712100 ） 摘 要：利用生物信息学方法，在西瓜测序基因组 97103 中共鉴定出 96 个 bHLH 家族成员，其中有 94 个可以被定位到西瓜的 11 条染色体上。通过基因结构和结构域序列保守性的预测，发现这些基因的序 列长度和内含子数量变化很大，但 bHLH 结构域序列比较保守。用拟南芥中 39 条已知的 bHLH 蛋白序列 和西瓜的 96 条 bHLH 蛋白序列构建系统发育树，结果显示西瓜的 bHLH 家族可以进一步被分为 11 个亚 族。运用荧光定量实时 PCR 技术，分析了该家族中 21 个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平，结果表 明，8 个基因受低温胁迫诱导表达，13个基因