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第十二章 DNA的复制、修复和重组 第一节 DNA的代谢 第二节 DNA复制的一般规律 一、关于模板的概念 模板(template): 1.早期推测模板分子的表面可以让许多小分子按一定排列顺序排列,然后连接这些小分子形成有特定结构和功能的大分子。 2.Watson-Crick DNA双螺旋结构表明,DNA双链严格按碱基配对互补,故,如以一条链为模板,可合成另一条有既定顺序的互补链。 二、DNA复制是半保留的 半保留复制(semi conservative replication): 亲代的DNA双链,每条链都可作为模板,复制一条新链。二个子代DNA分子碱基顺序与亲代分子完全一致,其中一条链来自亲代DNA链,另一条是新合成的。 三、DNA复制的起点与方向 复制从原点(origin)开始双向进行的 John Cairns experiment 四、DNA的复制是半不连续的 DNA合成的方向为5′?3′,复制是半不连续的。 第三节 DNA聚合酶 一、DNA是由DNA聚合酶催化合成的 1955年,Arthur Kornberg 及其同事从 E. coli发现I 型DNA 聚合酶(DNA polymerase I )。 DNA聚合反应的两个基本规律: 1. 所有DNA聚合酶催化DNA合成均需要模板(all DNA polymerases require a template). 2. 聚合反应需要引物(a primer is required). 二、E.coli的三种DNA聚合酶 DNA polymerase I (pol Ⅰ,Kornberg酶): 1.催化的反应: (1) 5′→3′的聚合活性; (2) 5′→3′外切酶活性:切除引物,切除突变片段。 (3) 3′→5′外切酶活性:切除错配的碱基。 3.主要功能: (1)在DNA复制、重组和修复起修缮工作用( 5′→3′外切酶活性)(This enzyme serves a host of “clean-up” functions during replication, recombination, and repair.) (2)对复制中的错误进行校读( 3′→5′外切酶活性,5′→3′ 聚合酶活性); 切口位移作用(nick translation): Pol I 的5′→3′ 外切酶活性可切除与模板链配对的 RNA 或 DNA 片段, 并同时用一条新合成的DNA链取代之。 DNA聚合酶Ⅱ( polⅡ) 1. 5′→3′聚合 ; 2. 3′→5′外切。 具有高度专一的DNA修复功能(appears to have a highly specialized DNA repair function )。 1.全酶含10种亚基,为不对称二聚体。 2.α,ε和θ 组成核心酶 (α具有5′→3′聚合 酶 活性, ε具有3′→5′外切酶活性和碱基选择功能) 。 3. ? 使核心酶形成二聚体。 4.γ2δδ′χψ构成钳安装复合物。 5.核心酶二聚体+钳安装复合物?Ⅲ*型DNA聚合酶(连续性低)。 4.β 形成围绕模板链的滑动钳,使酶沿模板链滑动?防止酶从模板解离?连续性↑。 三、 DNA聚合酶催化DNA合成的精确性 1.正确和错误核苷酸的区分: 依靠互补碱基正确配对建立的氢键: 不正确的碱基不能与模板链上的碱基形成正确的氢键。 2.DNA聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能: pol Ⅲ的ε亚基。 3.复制中出错时有即时的校读功能: pol Ⅰ的3′→5′外切酶活性。 四、DNA复制需要许多酶和蛋白质因子 E.coli的DNA复制需要至少20个酶和蛋白组成的DNA复制酶系统或复制体(the DNA replicase system or the replisome) 解旋酶(helicases) DNA拓扑异构酶(topoisomerases) DNA单链结合蛋白(single strand DNA binding proteins,SSB) 引物酶(primases) DNA连接酶(DNA ligases) 第四节 细胞DNA复制的阶段性 一、起始(initiation) E. coli的复制原点oriC由 245 bp组成: 二、延长(elongation ) 前导链的合成: 1. 引物(primer)的生成:由引物酶(primase)催化 (1)细菌:50~100nt; (2)哺乳动物细胞:10nt。 2.在RNA primer上由 pol
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