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遗传算法 Genetic Algorithm GA 简介 遗传算法 借鉴生物界自然选择原理和自然遗传机制而形成的一种迭代式自适应概率性全局优化搜索算法。 基本特点 简单易懂、通用、鲁棒性强、适合并行处理,可用于解决各种复杂优化问题 鼻祖 美国 密歇根(Michigan)大学 John Holland教授 一、算法提出依据 达尔文 (Darwin) 的进化论 英国自然学家,进化论的奠基人。 青年时期在爱丁堡大学和剑桥大学学习,特别喜爱博物学。大学毕业时22岁,以博物学者的身份登上英国海军舰艇贝格尔号(HMS Beagles),进行了5年(1831年—1836年)探险航行。 他观察了距厄瓜多尔西岸950km的加拉帕戈斯群岛上的海龟和地雀。 1859年,达尔文出版了《物种起源》这一划时代的著作。这一著作终结了神创论关于上帝创造人类的统治地位,使生物学开始成为科学,对人类的思想解放有巨大的意义。 达尔文 (Darwin) 的进化论 进化论是生物学最基本的理论之一。生物学上的所谓进化或者演化(Evolution),旧称“天演”,是指生物在变异、遗传与自然选择作用下的演变发展,物种淘汰和物种产生过程。地球上原来无生命,大约在30多亿年前,在一定的条件下,形成了原始生命,其后,生物不断的进化,直至今天世界上存在着170多万个物种。 达尔文用自然选择来解释生物进化。自然选择就是指生物由于环境中某些因素的影响而使得有利于一些个体的生存,而不利于另外一些个体生存的演化过程。 简而言之——物竞天择,适者生存 孟德尔(Mendel) 的遗传学 1822年7月22日孟德尔生于奥地利的海因岑多夫(今捷克的海恩塞斯)。他于1840年毕业于特罗保的预科学校,进入奥尔米茨哲学院学习。1843年因家贫而辍学,同年10月到奥古斯丁修道院做修道士。1847年被任命为神父。1849年受委派到茨纳伊姆中学任希腊文和数学代课教师。1851年~1853年在维也纳大学学习物理、化学、数学、动物学和植物学。1853年,他从维也纳大学毕业回修道院。1854年被委派到布吕恩技术学校任物理学和植物学的代理教师。并在那里工作了14年。1884年1月6日卒于布吕恩(今捷克的布尔诺)。 科学遗传学的奠基人 代表作 1865《植物杂交试验》 孟德尔(Mendel) 的遗传学 遗传学是研究基因及它们在生物遗传中的作用的科学分支。遗传学最早的应用在有历史记载之初就已经出现了,即驯养动物及植物的选择育种。遗传信息以化学方法被编码在DNA(脱氧核糖核酸)中。 1865年,孟德尔首先记录了豌豆某些特性的遗传模式,表明它们遵守简单的统计学规律。由他的统计分析中,孟德尔定义了一个概念:遗传的基本单位——等位基因。他描述的等位基因类于现在的基因。直到孟德尔死后,20世纪初另外的科学家重新发现这个定律之后,孟德尔的工作的重要性才被大家了解。 改变一个生物的DNA从而达到某种目的被称为基因工程。 遗传学时间表 1859年 查尔斯·达尔文发表了《物种起源》 1865年 格雷戈尔·孟德尔发表文章《植物杂交试验》 1903年 发现染色体是遗传单位 1905年 英国科学家威廉·贝特森在给亚当·塞奇威克的一封信中提出了“遗传学”这个名词。 1927年 基因的物理变化叫做基因突变 1931年 交叉互换导致了基因重组 1944年 奥斯瓦德·西奥多·艾弗里,科林·麦克劳德和麦克林·麦克卡提分离出遗传物质DNA(那时叫做遗传要素) 1953年 詹姆斯·沃森和弗朗西斯·克里克提出了DNA的双螺旋结构 1958年 Meselson-Stahl试验证明DNA是半保留复制的 1961年 提出三联体遗传密码 1977年 DNA测序 2001年 人类基因组序列草图由人类基因组计划和赛雷拉基因公司同时完成 如何借鉴? 对于一个优化问题,一定数量的候选解(生命个体)被表示为抽象的数字串(染色体),通过进化向更好的解发展。 选解一般为二进制数字串(即0和1),但也可能有其他表示。一开始,生命个体完全随机产生,之后一代一代的进化,在进化过程中的每一代,每一个个体的适应程度被评价,通过自然选择和变异产生新的生命群体,该群体就是下一代的个体。 遗传算法与自然进化的比较 二、算法发展回顾 遗传算法最开始是产生于Holland教授和他的同事对cellular automata的研究过程中。在二十世纪八十年代中期之前,对于遗传算法的研究还仅限于理论方面,直到在伊里诺斯大学召开了第一届世界遗传算法大会。随着计算机计算能力的发展和实际应用需求的增多,遗传算法逐渐进入实际应用阶段。 1989年,纽约时报作者约翰马克夫写了一篇文章描述第一个商业用途的遗传算法--进化者(Evolver)。 之后,越来越多种类的遗传算法出现并被用于许多领
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