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核酸提取 河南农大生命科学研究中心 张志坤 大 纲 一.综述 二.分论 (1).裂解细胞 (2).去除蛋白 (3).去除多糖 (4).去除多酚 (5).DNA RNA的分离 (6).常用的提取方法简介 (7).核酸质量的检测 (8).核酸的保存 (9).操作注意事项 三.结题 一.综述 1.什么是核酸提取? 核酸提取就是根据核酸和其他细胞组分理化性质的差别,从细胞中将核酸(DNA,RNA)逐级分离并 纯化出来的过程。 细胞的组成成分十分复杂,从结构上来讲,动物细胞及类病毒(衣原体支原体)外层有细胞膜(主 要成分为蛋白和脂类和糖类),细菌及植物细胞外层除了细胞膜外还有细胞壁和荚膜(主要成分是 多糖纤维素类和脂类),病毒外层为蛋白质外壳;细胞中层的内容物中的结构和成分更加复杂, (1)细胞质基质,包括无机离子(K,Cl,Na,Ca,Mg等),各种代谢的中间产物(脂类,单糖,氨基 酸,核苷酸和很多上述产物的中间体),蛋白质(包括酶类),脂蛋白,RNA mRNA,tRNA,rRNA和 很多小RNA及RNA的中间体 ,(2)核糖核蛋白体(蛋白质合成的场所),(3)线粒体及质体 其结 构和组成类似于细胞,同样有质膜,基质,骨架等,有些还有独立的遗传系统 ,(4)内膜系统 (主要是脂类和蛋白质,核糖核蛋白体附着在内膜上,是蛋白,酶,脂类,糖类合成的场所),(5) 液泡(主要是脂类,蛋白,和液泡基质),(6)细胞骨架(主要是蛋白质,支撑细胞正常形 态),(7)细胞外基质 主要是蛋白类物质,将同类细胞连接在一起 ,(8)细胞核(核膜,核 仁,核内容物,主要是DNA,RNA,蛋白质等)。 一.综述 一.综述 2.细胞组成成分 一.综述 3.为什么要提取核酸? 从组织中提取核酸是进行分子生物学方面研究的必要前提。要进行Southern,Northern 杂交分析,克 隆基因,基因检测,纯化mRNA以用于体外翻译或建立cDNA 文库,RT - PCR 及差示分析等分子生物 学研究,都需要高质量的核酸。因此,从组织中提取纯度高、完整性好的核酸是顺利进行上述研究的 关键所在。核酸提取是进行所有分子生物学研究的基础,没有高质量的核酸,分子生物学无从谈 起,因此核酸提取是分子生物学的一项基本功,大家一定要掌握。 4.核酸的理化性质 (1).溶解性(分离纯化核酸的重要依据) 它们都微溶于水,其钠盐在水中的溶解度较大。但不溶于乙醇、乙醚和氯仿等一般有机溶剂,因 此,常用乙醇异丙醇等有机溶剂从溶液中沉淀核酸,当乙醇浓度达50%时,DNA就沉淀出来,当乙 醇浓度达75%时RNA也沉淀出来。 DNA能溶于酸性苯酚中,而RNA不溶于酸性苯酚,此性质常用作分离DNA和RNA。在碱性苯酚 (PH 7.8)中,DNA和RNA都不溶解。在纯化DNA时,苯酚一定要平衡,确保其PH 7.8。 在一些高盐溶液中(如NaAc和LiCl),DNA和RNA的溶解性不同,据此可用不同浓度的盐溶液选 择性地沉淀DNA或RNA。 一.综述 4.核酸的理化性质 (2).解离性(核酸电泳的依据) 因为带有磷酸根,所以核酸是带有电荷的,据此我们进行核酸电泳,来鉴定核酸的分子量及完整性等。 (3).紫外吸收性(紫外检测的依据) 由于核苷酸的嘌呤嘧啶碱中具有共轭双键,因此核酸对紫外线有强烈的吸收。在260nm附近有最大吸收峰,在230nm有一个低谷。根据230nm,260nm,280nm,320nm处的吸收峰,我们可以对核酸进行纯度和定量检测。 (4).变性,复性和杂交(PCR及分子杂交的依据) 核酸具有全部 DS-DNA 或局部(SS-RNA)的双链结构,某些物理化学因素能破坏核算中的氢键,使有规律的双链结构打开,变成单链,此过程称为核酸的变性。如加热(DS-DNA94℃左右,SS-RNA70℃左右)酸或碱及某些变性剂。 变性的核酸在适当条件下,又可使彼此分开的链重新结合,此过程称为核酸的复性。如降低温度,去掉变性剂等。在变性和复性的过程中,有很多可人为控制的反应能够发生,如PCR时引物的与模板的结合等。 不同来源的具有互补序列的两条单链核酸分子在变性复性的过程中,也可以结合形成双链分子,此过程被称为核酸的分子杂交。包括DNA-DNA分子杂交,DNA-RNA分子杂交和RNA-RNA分子杂交,即Southern-Blot,Northern-Blot。分子杂交常被用于检测某条基因的丰度。 一.综述 5.核酸提取的一般步骤 二.1 裂解细胞 1.为什么要裂解细胞? 裂解细胞的目的是为了破除细胞壁,细胞膜让细胞内容物尽快的释放出来,从而为提取核酸做好准备。裂解细胞的过程就是我们在和核酸酶赛跑的过程,裂解细胞是提取核酸很重要的一环,直接关系着核酸的质量和得率。 2
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