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(3)稳定DNA双螺旋结构的作用力 (a)碱基堆积力 (base-stacking forces) (b)互补碱基对之间的氢键 (c)磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子之间形成的离子键 3.DNA双螺旋的种类 Watson Crick DNA双螺旋结构(B型DNA) 当DNA钠盐纤维相对湿度和盐的种类改变时, DNA的构象发生改变。 不同DNA的空间结构 类型 结晶状态 A Na盐,相对湿度75%时结晶 B Na盐,相对湿度92%时结晶 C 锂盐,相对湿度66%时结晶 (1)?? B—DNA:典型的Watson-Crick双螺旋DNA 右手双螺旋 每圈螺旋10个碱基对 螺距:3.4nm (2)? A-DNA 右手双螺旋,外形粗短。 RNA-RNA、RNA-DNA杂交分子具有这种结构。 (3)Z-DNA 左手螺旋,外形细长。 天然B-DNA的局部区域可以形成Z-DNA。 (4)?三股螺旋DNA K. Hoogsteen 1963 通常是一条同型寡核苷酸与寡嘧啶核苷酸-寡嘌呤核苷酸双螺旋的大沟结合 ★第一股是寡嘧啶,中间是寡嘌呤,第三股可以是寡嘧啶或寡嘌呤 T= A : A , C≡G : C+ T = A : T C≡G : G P489 图13-10 三股螺旋DNA中的碱基配对 ★第三股与寡嘌呤之间同向平行,并按Hoogsteen配对 ★当DNA的一段寡嘧啶(寡嘌呤)构成镜像重复时可以形成三股螺旋(铰链DNA,hinged DNA , H-DNA) P 490 图13-11 H-DNA的结构 ★DNA三股螺旋结构常出现在DNA复制、转录、重组的起始位点或调节位点,如启动子区。 第三股链的存在可能使一些调控蛋白或RNA聚合酶等难以与该区段结合,从而阻遏有关遗传信息的表达。 (5)四螺旋DNA (二)、?DNA的三级结构 DNA的三级结构是指DNA在双螺旋的基础上通过扭曲和折叠形成的构象 ★超螺旋是DNA三级结构的主要形式 1、?? 环状DNA的三种典型构象 P491 图13-12 (1)、? 松弛环形DNA 线形DNA直接环化 (2)、? 解链环形DNA 线形DNA拧松后再环化 (3)、 正超螺旋与负超螺旋DNA MOV : PBC\A0267501\supercoiling of DNA 超螺旋DNA的性质 结构紧密,浮力密度大,沉降速度快。 2.开环DNA(open circular DNA, ocDNA) 也称松环DNA(relaxed circular DNA, rcDNA) + (三)、DNA与蛋白质复合物的结构 生物体内的核酸通常与蛋白质结合形成复合物,以核蛋白的形式存在。 1.病毒:病毒颗粒主要由蛋白质和核酸(脂质、糖类)组成。动物病毒主要为DNA病毒,植物病毒主要为RNA病毒。 2.细菌的拟核 细菌基因组为双链环状DNA,与碱性蛋白和少量RNA结合,形成突环结构。其DNA分子的长度大约是其菌体长度的1000倍。所以细菌DNA在细胞内紧密缠绕形成致密的小体,称为拟核(nucleoid). 3.真核生物的染色体 DNA双链以左手螺旋缠绕在组蛋白形成的八聚体核心上.即核小体 念珠状结构 核小体链进一步盘绕、折叠形成染色质丝 组成突环 玫瑰花结 螺线圈 由螺线圈组装成染色单体。 真核生物的染色质丝 组蛋白八聚体:H2A H2B H3 H4各2个分子 从DNA到染色质丝,DNA压缩了近100倍,若从DNA到最后凝缩成染色体,DNA压缩了近万倍。 2’,3’,5’一核糖核苷酸 (2′-AMP) (3′-AMP) (5′-AMP) 3’,5’一脱氧核糖核苷酸 Deoxyadenosine 3’- monphosphate (3’- dAMP) Deoxyadenosine 5’- monphosphate (5’- dAMP) (2)脱氧(核糖)核苷酸(deoxyribonucleotide): ATP 5′ 1′ 焦磷酸 环状核苷酸(cAMP) 3’ 5’ cAMP在细胞内起传递细胞外信号的作用,被称为“第二信使” 。 DNA与RNA分子组成的比较 磷酸 核 糖 C,U A,G RNA 磷酸 脱氧核糖 C,T A,G DNA 磷酸 戊 糖 嘧 啶 嘌 呤 链数 双链 单链 第三节 核酸的结构 一、一级结构 核酸分子是由核
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