蛋白质的功能及其结构基础概要.pptVIP

二、蛋白质的结构是蛋白质功能的基础 蛋白质的结构是其功能的分子基础，这是不言而喻的，因为不同功能的蛋白质都具有相应的但又不同的结构。 蛋白质一般都是分子质量较大的分子，因此，不可能整个分子的所有部位均与其活性密切相关，而仅是分子中的某些局部的区域是蛋白质的活性部位，通常称之为活性中心。多数蛋白质的活性中心不止一个。 例如，具有酶活性的蛋白质中，一般都有一个底物结合部位，此外，还有一个催化部位；而在具有别构活性的酶中，还存在着与其他调节剂先后湖作用的别构部位。在多个蛋白质构成的体系中，为了能将自身融合与体系中，一些蛋白质同样需要2个或多个活性位点。一些位点是直接行使功能的，另一些则起到与体系中其他成分协调的作用。 （一）蛋白质功能的趋异现象 由于蛋白质的功能经常是与分子结构中的局部区域有关的，因此，一些蛋白质的总体结构很相似，可被归属于一个蛋白质超家族，甚至是同一家族，但是它们的功能却有很大的不同，目前这样的例子越来越多。 这是因为划分蛋白质的家族和超家族的原则是依据蛋白质总体的结构，而没有考虑蛋白质局部的结构；即考虑的是蛋白质总体的规正的二极结构（α螺旋和β折叠链）以及它们在空间的排列类型，而没有顾及连接规正的二极结构的、其他的部分规正的和可变的二极结构，如β转角、环形和“无规”卷曲以及各种局部的细微差别。 例如，许多丝氨酸蛋白酶的催化位点是相同的，但是它们的底物结合位点不同。针对这种情况，提出了蛋白质的功能在演化撒谎能够的趋异现象，即一些蛋白质可能是来自同一个祖先分子，在同一个结构的基础上，保留了整体结构，却改变了局部的结构，导致了功能的改变。 （二）蛋白质功能的趋同现象 应该指出的是，不能将蛋白质的功能与结构的相互作用关系理解为一一对应的关系，即只有一种结构的蛋白质才能行使某种特定的功能。事实上，有些结构不同的蛋白质却能行使相同的功能。与趋异现象相反，这是一类趋同现象。 同样是丝氨酸蛋白酶，微生物中的这种酶的总体结构不同与哺乳动物中的蛋白酶，但是它们的催化活性部位却都是由丝氨酸—天冬氨酸—组氨酸组成的电荷中继系统。 （三）同一蛋白质中存在着功能相似而结构不相同的位点 生长激素与其受体可以形成复合物。此复合物含有1分子激素和2分子分子受体，但是生长激素并没有2个对称的、相同的与受体结合的活性部位。相反的，生长激素是通过分子表面2个完全分子上相似的位点结合。这样的相互作用迄今还很少见的。 α螺旋可以是两亲螺旋，即最后形成的螺旋的一个侧面集中了疏水性氨基酸残基，而其几乎对称的另一个侧面却全是亲水性的氨基酸残基。这种两亲螺旋在水溶液和亲水环境中是不稳定的，它们疏水侧面有远离水和亲水环境而自身聚集的倾向。因此，2段两亲螺旋就形成了一种类型的超二级结构，可称之为螺旋束，该螺旋束进一步形成4股螺旋的螺旋捆。在形成了四螺旋捆后，肽链中的一些疏水性氨基酸残基被包埋在分子中。 三、蛋白质和其他分子相互作用中的互动 蛋白质在行使功能时，不仅是蛋白质对其他分子的作用，期间也有其他分子对行使功能的蛋白质的作用，即作用是相互的。如果将行使功能的蛋白质片面的理解为，只有被其作用的底物或配体发生了结构的改变，而主导作用的蛋白质不发生改变，则是不可想象的。换言之，只有“活的”、自身也在改变结构的分子才能行使其“活性”；不变的“死”分子，是没有“活性”而言的。 第三节蛋白质功能和一级结构的关系 一、一级结构中保守氨基酸残基在蛋白质功 能中的作用 蛋白质中与功能有关的活性部位均由特定的氨基酸残基组成的。不同种属具有同样功能的蛋白质内，活性部位的氨基酸残基是保守的，其中相当部分甚至是不变的。越是重要的、越是普遍存在的蛋白质，在演化过程中，氨基酸残基的突变越少。 对从一些亲缘关系很远的物种分离得到的细胞色素c的构象进行比较，可以发现，他们的外周构象可以有较大的差异，但是中心与血红素结合的区域构象却非常相似。这说明，与活性相关的肽段的一级结构的相似性决定了蛋白质中活性部位立体结构的相似性。 所谓的分子病为研究蛋白质一级结构与蛋白质功能关系提供了另一些非常有用的材料。因为“患有疾病”的分子与正常蛋白质的氨基酸序列相比，往往只是个别或极少的几个氨基酸残基的改变，而这些氨基酸残基的突变却能产生严重的后果，这就表明了这些氨基酸残基在功能中的重要性。发生这些突变的原因是随机的；可能是无“目的”的；也可能是有“目的”的，希望通过突变，能筛选到某些新的功能，以适应外界环境。然而，也可能新的突变解决了一些矛盾，同时又付出了一定的代价。 例如，目前较常用的方法是丙氨酸扫描，即将不同位点的氨基酸残基突变成为丙氨酸，然后观察突变的功能。由此了解肽链中每个氨基酸残基和功能间可能的关系。同时也为蛋白质工程中改造蛋白质、生产新的蛋白质提供依据。从理论上说，除了丙氨酸