化合物の立体構造の決定に関する話 -.pptVIP

CIP則（Cahn-Ingold-Prelog） 立体化学命名法(E/Z,R/S)における置換基の優先順位付けのルール 原子番号大＞原子番号小（同位体は質量数大が優先） 2)　多重結合は複数の単結合と見なして考える Enantiomerと生理応答 化合物の絶対立体配置の決定について 答：以下のいずれかによる １の方法について ２の方法について 単結晶からのＸ線回折像の例 回折像から計算で求められる結晶構造の例 結晶構造から分子の立体構造を知る ３の方法について １９５１年までの世界 １９５１年以後 * スペアミント キャラウェイ（和名：ヒメウイキョウ） Carvone 問）ある新規なキラル化合物の光学活性体を入手した。その２次元構造は　すでに分かっている。ではその立体構造は？ 　参考までに，今，たまたま手元に天然アミノ酸であるフェニルアラニンの瓶があって，ラベルにはＬ－（－）－フェニルアラニンと書かれている。ちなみに，Ｌ体のフェニルアラニンはＲＳ命名法ではＳ体である。 　さて，件の未知物質の旋光度を測ったところ，その符号は（＋）であった。 そこで三択 （＋）なのでＲ体。 （＋）なのでＤ体。 旋光度の符号から立体構造を決められない。 正解は３． →では，どうすれば決められる？ 化学反応を行って，立体構造既知の何らかの化合物との関連付けをして，旋光度の符号により決定する。 その化合物と，立体構造既知の化合物との間で，塩を形成させたり，結合を作るなどして，結晶性の化合物に導く。その後に，Ｘ線単結晶構造解析で決定する。 その化合物を重元素の塩にしたり重元素との結合を形成させるなどした後，単結晶を得て，異常分散を利用したＸ線単結晶構造解析で決定する。 化学反応により，立体構造既知の化合物との関連付けを行い， 旋光度の符号により決定する。 例：（＋）体の乳酸CH3CH(OH)COOH（１）の立体構造は？ （実験事実群） １．（－）体のＢｒCH2CH(OH)COOH （２）のＢｒを還元したら（－）体の乳酸(1’) が得られた。 ２．（＋）体のNH2CH2CH(OH)COOH（３）をNOBrで処理したら（－）体の２が得られた。 ３． 同じ（＋）体の３をＨNＯ2で処理すると，（－）体のＨＯCH2CH(OH)COOH（４）が得られた。 ４．一方，（＋）体のグリセルアルデヒドＨＯCH2CH(OH)CＨＯ（５）を酸化すると（－）体の４が得られた。 ５． ５の立体構造は既知であり，それは下のようなものである。 以下の相関により決定される。 使える化学反応に制限あり その化合物と，立体構造既知の化合物との間で，塩を形成させたり，化学結合を作るなどして，結晶性の化合物に導く。その後に，Ｘ線単結晶構造解析で決定する。 例：（－）体のマンデル酸ＰｈCH(OH)COOH（６）の立体構造は？ （実験事実） １．（－）体の６と（＋）体のフェネチルアミンＰｈCH(ＮH2)CH3 （7）の塩の単結晶が得られ，そのＸ線構造解析を行った。 ２．（＋）体の７はＲ体であることがわかっている。 ?マンデル酸とフェネチルアミンの塩の結晶構造。 ?結晶格子中に分子が規則正しく配列している様子が分かる。 ?各原子の空間座標により，化合物の相対立体配置がわかる。（＋）フェネチルアミンがＲ体と分かっているので，（－）体のマンデル酸はＲ体であることが確定した。 ?このように，Ｃ，Ｈ，Ｏ，Ｎなど軽い元素だけでできた分子のＸ線解析は，完全に立体の反転した結果を与えることがある。つまり，絶対立体配置まではわからない，ということ。 （＋）フェネチルアミン （－）マンデル酸 さて，１の方法ではグリセルアルデヒドが，２の方法ではフェネチルアミンが，それぞれ旋光度の符号と分子の立体構造の関係が既知の化合物として取り扱われていた。 では，いったいそれらの化合物の立体構造はどうやって決定されたのか？ それらが１や２の方法で決定されたとすると，そのためにまた別の“基準化合物”が存在したはずで，突き詰めると，“大元の基準化合物”があってそれに従ったのだ，ということになる。それは何？どうやって決まったのか？ これは，１９５１年以前と以後で大きく異なる “大元の基準化合物”はなかった。 しかしながら，１の方法によっていろいろな化合物の相対的な関係は相当量の蓄積があった。たとえば，天然のアミノ酸は全てが同じ立体構造をもっていることなど。 それを例えば『（＋）体のグリセルアルデヒドと同じ立体構造でない方のロイシン』などといっていてはいかにもまだるっこしい。 そこで，１９世紀後半にFischerは『便宜的に（＋）体のグリセルアルデヒドをＤ体とする』と宣言した。これにより，紙の上で光