7DNA复制-PCR.pptVIP

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7DNA复制-PCR.ppt

遗传物质的复制 南通大学江苏省神经再生重点实验室 蒋茂荣 DNA的半保留复制 一、DNA复制采用的是半保留复制方式  半保留复制(Semiconservative Replication) DNA复制是分别以亲代螺旋双链中的一条为模板合成其互补链,由此产生的两条子代双螺旋都是由一条亲代链和一条新合成链组成,因此称做半保留复制。 半保留复制的实验证实    Meselson和Stahl密度标记实验 复制起点、方向和速度 复制子(replicon):基因组中 DNA分子复制的单位,其中包含一个起始复制的复制起点。细菌染色体、质粒、噬菌体和其它病毒只有一个复制起点,因此整个DNA分子就构成一个复制子,而真核生物染色体有多个的起始点,因此含有几个复制子 复制起点(origin)  染色体中DNA分子开始复制的特定位置就是复制起点;  复制起点的特征:复制原点通常富含A/T碱基对,回文序列和重复序列也是复制起点常见的DNA结构;复制起点中的顺式DNA序列通过与特异的反式作用蛋白质因子反应激活复制起点;  许多原核生物的复制起点有比较固定的碱基顺序和结构,不同物种间保守性较高 半不连续复制(semidiscontinuous replication) 半不连续复制 DNA合成的一种模式。以两条亲本链为模板合成子代链时,一条子链的合成是连续的,另一条是不连续的。 先导链(leading strand) 、后滞链(lagging strand) 与冈崎片段(Okazaki fragment) 以两条亲本链为模板合成子链时,一条子链可沿自身5‘→3’方向持续合成,即前导链;而另一条子链的合成是不连续的,即后滞链。在后滞链的形成过程中,首先以亲本链为模板按照自身5’→3’方向合成出许多1kb-2kb的短的不连续片段,这些片段被称做冈崎片段,然后这些短片段共价联结成一条完整的后滞链,后滞链的成长方向与其片段的合成方向相反 参与复制的酶和蛋白质因子 复制体(replisome) 担负DNA合成工作的多聚蛋白结构,在细菌复制叉处装配。包括了DNA聚合酶和其它酶类。 DNA复制酶(DNA replisase) 具有确定的DNA复制合成功能的酶。 构成复制体的几种主要酶类及蛋白质因子 DNA聚合酶(DNA polymerase) DNA连接酶(DNA ligase) 单链结合蛋白(single strand binding protein, SSB) DNA解旋酶(DNA helicase) DNA拓扑异构酶(topoisomerase) DNA引发酶(DNA primase) RNaseH 目 录  PCR的概念  PCR技术的创建  PCR的原理  PCR的反应体系和方法  PCR的类型和应用 目 录  PCR的概念  PCR技术的创建  PCR的原理  PCR的反应体系和方法  PCR的类型和应用 目 录  PCR的概念  PCR技术的创建  PCR的原理  PCR的反应体系和方法  PCR的类型和应用 引物设计网址: /cgi-bin/ primer/primer3_www.cgi 引物设计软件 Primer 5 目 录  PCR的概念  PCR技术的创建  PCR的原理  PCR的反应体系和方法  PCR的类型和应用 10×PCR buffer 5μl dNTPmix(2mmol/L) 4μl 引物1(10pmol/L) 2μl 引物2(10pmol/L) 2μl DNA模板(50ng-1μg/μl) 1μl Taq 酶(2U/μl) 1μl 加双蒸水至总体积为100μl 注意事项 目 录  PCR的概念  PCR技术的创建  PCR的原理  PCR的反应体系和方法  PCR的类型和应用 相同模板在同一台PCR仪上进行96次扩增的扩增曲线图 2 )高度的特异性 引物 引物 引物的序列及其与模板结合的特异性是决定PCR反应结果的关键。 引物设计的最大原则是最大限度地提高扩增效率和特异性;同时尽可能减少非特异性扩增。 引物设计: (1) 序列应位于高度保守区,与非扩增区无同源序列。 (2)引物长度以15-30bp为宜。上下游长度差别3bp (3)碱基尽可能随机分布,G+C占40-60% 。 (4)引物内部避免形成二级结构。 (5)两引物间避免有互补序列。 (6)引物3’端为关键碱基,尽可能为G/C;5’端无严格限制,可加入限制性酶切位点。 (7)解链温

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