系统发育树构建PPT构建步骤2013.12.15.ppt

多序列比对及  系统发生树的构建 主要目的： 了解分子进化及系统发育分析 掌握多序列比对方法 熟悉系统发育树建立方法 掌握用Mega软件进行构建系统发育树 系统发生（phylogeny）——是指生物形成或进化的历史 系统发生学(phylogenetics)——研究物种之间的进化关系 系统发育树（phylogenetic tree）——描述物种之间进化关系 系统发育树（phylogenetic tree）——又称evolutionary tree进化树)就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓扑结构。它可以用来研究不同物种间的进化关系，这一直是生物学的研究热点。 拓扑（Topology）将讨论范围内的事物之间的相互关系表示出来，将这些事物之间的关系通过图表示出来。 两个临近的分支的连接处称为节点（node）,表示推断祖先的现存类群在树最底部的分支点成为根节（root node）, 一个单一的共同的祖先被定义为进化支（clade）或者单源群（monophyletic group） 树的分支模式被成为拓扑结构（tree topology） 系统发育树建立方法 NCBI——BLAST——输入序列对比——记录好以下几方面： 名 称： Uncultured bacterium clone YU201H10 序列号： FJ6