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医学分子生物学(补充知识点)
第一到四章(答案见重点)
1)细胞DNA克隆的主要步骤。
2)载体的一般特性以及常用载体的种类和特点。
3)PCR的基本原理、特点以及应用。
4)DHPLC分析DNA变异的原理。
5)染色质免疫沉淀技术(ChlP)的基本原理及应用。
6)miRNA的概念、作用机制及研究策略是什么。
7)在制备转基因动物时,影响转基因表达的因素有哪些?
8)蛋白质表达的检测方法有哪几种?各自的主要应用是什么?
9)亚硫酸氢盐处理DNA后,进行DNA甲基化检测的基本原理是什么?相关检测方法有哪些?
概念:基因组DNA文库 、实时荧光定量PCR、RNA干扰、基因打靶、表观遗传学、蛋白质组学、报告基因
概念:1,实时荧光定量PCR:指在PCR 反应体系中加入荧光基团, 利用荧光信号积累实时监测整个PCR 进程,进而对起始模板进行定量分析的方法。
2,RNA干扰:是一种由双链RNA(dsRNA)始动的序列特异性基因沉默机制。
3,基因打靶:是利用活细胞染色体DNA可与外源DNA的同源序列发生同源重组的性质, 以定点修饰改造染色体上某一基因的方法。
4,表观遗传学:研究有丝分裂和/或减数分裂可遗传的基因功能改变,而不涉及DNA序列的改变。
5,蛋白质组学:蛋白质组学是指从整体角度分析细胞或组织内蛋白质组成成分、表达水平与修饰状态等。在相关的样品间比较细胞中所有蛋白质的表达,鉴定差异表达的蛋白质,称表达蛋白质组学。
6,报告基因:是一种编码易被检测的蛋白质或酶的基因。报告基因检测是真核生物基因表达调控研究的常用方法
论述题
1)细胞DNA克隆的主要步骤。
2)载体的一般特性以及常用载体的种类和特点
质粒
λ噬菌体:高效感染细菌的病毒;DNA分子为线性双链5′末端是12个核苷酸突出的粘性末端,又称cos序列。进入宿主细胞后,COS序列碱基配对环化。
①置换λ载体:外源DNA片段取代λ噬菌体DNA分子中间部分的基因。插入9-23kb,常用于制备基因组DNA文库
②插入λ载体:外源DNA片段插入λ基因组的CI基因.插入片段:〈10kb
常用于制备cDNA文库
粘粒:将质粒和λ噬菌体改建的载体,改造后含λ噬菌体的COS序列以及质粒(plasmid)特性:携带外源DNA分子约30-45kb。
P1噬菌体和P1衍生人工染色体(PAC):P1噬菌体:其DNA为线性,体外包装于蛋白质壳内。P1DNA进入宿主细胞后环化,扩增。携带外源DNA片段约100kb
将P1噬菌体和F因子结合构成了PAC,携带外源DNA片段约130-150kb。
细菌人工染色体:是基于大肠杆菌的F因子构建的、低拷贝的质粒载体。(F因子是大肠杆菌中自然存在的一种致育质粒,编码多种参与复制、分配和接合过程的蛋白质)。它不同于一般质粒,能携带外源DNA片段300kb
酵母人工染色体:YAC的结构特征1)着丝粒:有丝分裂姊妹染色单体分离之必需。2)端粒:保护染色体末端免受核酸酶侵袭。3)自主复制序列(ARS)元件:染色体自主复制的起点。与外源DNA连接成线性DNA分子,导入酵母细胞克隆。携带外源DNA片段:0.2-2Mb
3)PCR的基本原理、特点以及应用
PCR特点 快速:PCR一个周期仅为3-5分钟,经过 30个周期约几个小时,可得到足量的目的DNA用于分析 灵敏:PCR能够扩增少量目的DNA,甚至单个细胞DNA,有助于极少量标本的研究;如法医学物证、分子病理学、产前基因诊断等。适用样品广泛:有时标本是混杂物,难以分离DNA或DNA部分降解,如化石标本、福尔马林固定的标本等。
PCR局限性①产物片段短小:一般小于5kb②一定的错配率: 高保真Taq酶可大大降低错配率;它适合对PCR保真性要求较高的实验,如基因筛选、测序、突变检测等③产量有限:单一PCR反应中克隆的DNA量有限,且有时不适合某些后续研究。
可利用细胞克隆体系来克隆PCR产物。获得大量的目的DNA进行各种分析。
PCR应用非常广泛:各种生命现象的生理、病理机制的研究;疾病诊断;法医学;
考古学等。
DHPLC分析DNA变异的原理。
5)染色质免疫沉淀技术(ChlP)的基本原理及应用。
6)miRNA的概念、作用机制及研究策略是什么。
microRNA(miRNA,即微小RNA)是一类内源性的、长约21~25个核苷酸的小分子非编码RNA,对基因表达具有重要的调控作用。
作用机制:1) miRNA与靶 mRNA不完全互补,主要影响翻译过程而对mRNA的稳定性无影响。2)若二者完全互补,类似siRNA与靶mRNA的结合,特异性的切割mRNA;或通过使mRNA去poly A尾,使其稳定性降低而降解。
研究策略:1、表达检测:Northern Blot; Real time PCR ; miRNA芯片;深度测序等检测表达
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