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作图群体概念及分类介绍 yangzhou@ 2015-7-28 数量性状 质量性状 受多基因控制 单基因或寡基因控制 表型连续变异，杂交分离世代难以明确分组，个体在数量和程度上的差异只有通过度量才能具体化，度量值要用统计方法处理 表型不连续变异，杂交分离世代可以明确分组，可通过对不同类别个体计数，计算分离比，确定基因的数目和作用方式 表型易受环境条件的影响 不同环境中表现一般比较稳定 数量性状和质量性状的区别 亲本（ Parent）： 杂交亲本的简称，指动植物杂交时选用的雌雄个体。用符号P表示，参与杂交的雄性个体叫父本（ ♂） ；参与杂交的雌性个体叫母本（ ♀ ） 杂交（ Hybridization ）： 通过不同的基因型的个体之间的交配而取得某些双亲基因重新组合的个体的方法 自交（ Selfing ）： 自交指来自同一个体的雌雄配子的结合或具有相同基因型个体间的交配 F1： 亲本杂交产生的子一代 基因的加性效应（Additiveeffects）： 指基因位点内等位基因的累加效应,是上下代遗传可以固定的分量,又称为“育种值”，是性状表型值的主要成分。 显性效应（Dominant effect）： 指基因位点内等位基因之间的互作效应，是可以遗传但不能固定的遗传因素，是产生杂种优势的主要部分。 上位性效应（Epistatic effect）: 指不同基因位点的非等位基因之间相互作用所产生的效应。一对基因显性基因的表现受到另一对非等位基因的作用，这种非等位基因间的抑制或遮掩作用叫上位效应。起抑制作用的基因称为上位基因，被抑制的基因称为下位基因。 回交（Backcross） ： 回交是双亲或杂种的其他后代与亲本之一的杂交的方式 测交（ Test Cross ）： 未知基因型的显性个体和隐性纯合体亲本的交配方式，用以测定显性个体的基因类型 轮回亲本：被用来回交的亲本 非轮回亲本：未被用来回交的亲本 Xu 2010, Molecular Plant Breeding, CABI 部分作图群体和他们之间的关系 群体类型 双亲本作图群体 多亲本作图群体 自然群体 双亲本作图群体 初级作图群体 临时性分离群体（F2和回交群体） 永久性分离群体（DH、RIL、IF2） 次级作图群体 初级分离群体衍生系群体（NILs、RHLs） 代换系群体（Ils、CSSLs） 临时性分离群体： 初级作图群体 临时性分离群体的显著特点是这一类群体为暂时性分离群体。 优点： 构建时间短 缺点： 个体自交后代将出现分离，仅能使用一次，不能永久保存，不能进行多年多点田间试验 遗传背景复杂，容易造成定位偏差，很难对单个进行准确鉴定和定位 F2群体 F2群体构建过程 由两个不同基因型的纯合双亲杂交产生F1代，又自交而形成F2代所构成的群体称为F2群体 优点： 易于配制，需要时间短 遗传信息丰富，可以估算加性效应和显性效应。 缺点： 表型可靠性差 表型重复性差 检测微效基因能力较差。 BC群体 是由杂合子（通常为F1）与纯合（轮回）亲本回交1-2次产生。为了弥补回交群体的不足，现在多采用先回交再自交的方式，对回交后代进行自交 优点： 易于配制，短时间即可建立一个回交系群体 缺点： 材料有限，只能使用一代 表型重复性差 重组交换的信息量比F2群体少 这类群体以株系为分离单位，每一株系在遗传上是纯合的，可以不断繁殖，反复使用，主要用于高精度和高密度作图。 永久性分离群体 优点： 可多年多点进行表型鉴定，可同时考察多种表型，提高了作图精准度 等位基因都是固定的，可无限地用于新标记作图，可在研究小组中共享 分子标记基因型可用自交产生的10～20 个单株的混样而更准确的测定 缺点： 构建年限较长 由于不存在杂合位点，因此不能分析显性效应 定位分辨率低 RIL群体 RIL群体构建过程 RIL（Recombinant Inbreed Lines）群体，即重组自交系群体。将F2个体连续自交或同胞交配、或群体内随机交配，使得杂种的基因得以分离并进行重组，直至家系内个体基因型纯合稳定、家系间基因型各异，这些家系就构成了重组自交系群体。 优点： 个体基因型纯合，自交不分离 经历了多次减数分裂重组程度高于F2群体，其遗传图谱比F2的有着更高的解析度 缺点： 构建年限较长，在基因组的某些区域的纯合比理论预期需要更长的时间 不能估计显性效应 DH群体 DH（DoubledHaploid）群体，即双单倍体，是通过F1诱导单倍体并加倍形成的群体。 优点： 植株是纯合体，自交后代是纯系 可以进行多年多点的重复试验，是研究基因型和环境互作的理