生物统计期末复习教材.docVIP

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12营养2班生统复习资料 制作者:冯波 R语句集合: 变量- 数据 x - 1:5 #生成整数数列 x - seq(1, 5, 0.1) #生成数列 x - rep(5:6, times=10) #重复数列 x - rep(5:6, times=c(3,2)) #重复数列 x - rep(4:6, times=1:3) #重复数列 x - rnorm(10, 0, 1) #生成随机数字 x - c(480,490,500,505,510,520,535,560,585,600) #录入数据 median(x) #中位数 mean(x) #算术平均数 table(x) #众数 which.max(table(x)) #众数 range(x) #范围 var(x) #方差 sd(x) #标准差 summary(x) #简单统计描述 max(x),min(x),sum(x) 二项分布概率函数:dbinom(k, n, p) 二项分布分布函数:pbinom(k, n, p) 单个总体均数的假设检验 t检验: days - c(116,115,113,112,114, 117, 115, 116, 114, 113) #录入数据 t.test(days, mu = 114) #假设检验 t检验(单边): vc - c(255, 260, 262, 248,244, 245,250, 238, 246, 248, 258, 270) t.test(vc, mu = 246,alternative=greater) #算小于就把greater换成less两样本平均数的假设检验 1.非配对样本 bf1 - c(1.2, 1.32,1.1,1.28,1.35,1.08,1.18,1.25,1.3,1.12,1.19,1.05) bf2 - c(2,1.85,1.6,1.78,1.96,1.88,1.82,1.7,1.68,1.92,1.8) #录入数据 t.test(bf1,y=bf2,var.equal=T) #假设检验1 var.test(bf1,bf2) #方差同质性检验 t.test(bf1,y=bf2,var.equal=F) #假设检验2 此案例假定两样本方差相同? 使用假设检验1 若两样本方差未知,需进行方差同质性检验, p0.05 ? 方差不等? 假设检验2 p0.05 ? 方差相等? 假设检验1 2.配对样本 tmp1 - c(37.8,38.2,38.0,37.6,37.9,38.1,38.2,37.5,38.5,37.9) tmp2 - c(37.9,39,38.9,38.4,37.9,39,39.5,38.6,38.8,39) t.test(tmp1,y=tmp2,paired=TRUE) 单因素方差分析 ls - c(8,13,12,9,9, 7,8,10,9,7, 13,14,10,11,12, 13,9,8,8,10, 12,11,15,14,13) bred - as.factor(rep(1:5,each=5)) case1 - aov(ls~bred) summary(case1) TukeyHSD(case1) #多重比较 数据转换 rate-c(94.3,64.1,47.7,43.6,50.4,80.5,57.8,26.7,9.4,42.1,30.6,40.9,18.6,40.9,18,35,20.7,31.6, 26.8,11.4,19.7)/100 area - as.factor(rep(1:3,each=7)) rate2 - asin(sqrt(rate)) #反正弦转换 case1 - aov(rate~area) case2 - aov(rate2~area) summary(case1) summary(case2) plot(density(rate),col=blue) #绘图 lines(density(rate2),col=red) #添加曲线 两因素方差分析 dog-c(45,69,53,51,51,50,62,68,52,18,25,32,54,72,69,66,53,63,67,70,51,59,47,42,91,87,89,91,69,73,77,74,66,68,70,64) train -as.factor(rep(rep(c(‘A’,‘B’,‘C’),each=4),3)) prize - as.factor(rep(c(A,B,C),each=12)) case1 - aov(dog~train+prize+train*prize) summary(case1) TukeyHSD(cas

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