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* 真核细胞DNA的分离提取 及酶切电泳 生物化学:王丽华 实验安排 1、上午:基因组DNA的提取 2、中午:酶切 3、下午:琼脂糖凝胶电泳鉴定 移液器 微量分析 1、根据取样量,选择合适量程的加样器。 2、如何调节? 顺时针调节--- 读数变小 逆时针调节--- 读数变大 注意:调节前,加样器读数正处于最大量程或最小量程时,如果向错误方向调节,马上会超出量程,将会损害加样器的精度。 (1)吸头的安装要紧密。 (2)打到第一挡,将吸头插入液面下适当 深度,缓慢松开拇指,吸取液体。拇指完全放开后,吸头在液面下停留一下(约半秒钟) (3)将外壁液体用容器口引流回容器。吸头内的体积应大致正确。(5)贴目的容器内壁,加样器推到第二挡。将液体匀速打到目的容器内, 观察吸头内液体是否完全打出。 台式高速离心机 centrifugation 离心 1、打开电源。 2、盖紧盖子,防止离心机被腐蚀。 3、标记,配平, 对称放入离心机(管的连接处朝外). 4、设定离心的转速和时间 5、统一离心。 废液 废头 污染废物 污物处理 实验步骤 第一部分:裂解细胞膜、提取白细胞核 第二部分: 裂解核膜,释放基因组。 第三部分:去蛋白 第四部分:乙醇沉淀DNA 第五部分:酶切,DNA电泳 (标管号) 1 抗凝血--0.3ml 。 2 STMT--1ml,充分颠倒混匀(酒红色)。 3 10,000×g 离心 2min,弃上清,倒置于滤纸。 4 生理盐水--0.4ml, 混匀, 10,000×g离心2min,弃上清。 5 NE溶液--450μl 悬浮沉淀。 6 10%SDS--50μl 迅速混匀, 蛋白酶K--50μl,轻轻摇匀, 水浴1h(50℃)。 7 TE饱合酚--500μl,轻摇 2min, 10,000×g离心 1min, 上层水相移至另一Ep管(用100μl枪×?次)全取。 8 酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)500μl,轻摇 1min, 10,000×g离心 1min, 上层水相移至另一Ep管(用100μl枪×?次)全取。 9 氯仿-异戊醇(24:1)500μl,轻摇 1min, 10,000×g离心 1min, 上层水相移至另一Ep管内 (用100μl枪×?次)计量。 10 NaAc-- v,混匀 (离心机甩下)。 11 无水乙醇 -- 2倍v,混匀,-70℃ 15min。 10 1 12 10,000×g离心 5min,弃上清。 13 滤纸条吸残液,室温干燥 10min。 15 DNA液 -- 8μl,EcoRⅠ --1μl (提供内切酶反应最适条件) 10×TE缓冲液 --1μl 37℃水浴 60min 14 加双蒸水 -- 20μl,溶解沉淀 8μl:酶切 12μl:电泳对照 真核细胞DNA的分离提取 及酶切电泳 第一部分 DNA的分离提取 第二部分 电泳检测 掌握人外周血基因组DNA的提取原则和方法 实验目的 掌握琼脂糖凝胶电泳分离DNA的原理和方法 (Genome) 样品:人外周血 白细胞核中DNA 1步 抗凝血 2步 STMT溶液 3步 离心,弃上清,倒置于滤纸 4步 生理盐水 混匀, 离心 ,弃上清 一、裂解细胞膜提取细胞核 二、裂解细胞核膜释放基因组 (准备保护DNA) 5步 NE溶液 NaCl(高浓度Na+) EDTA 抑制DNase 破坏核膜 6步 SDS溶液 三、DNA与蛋白质解离 6步 蛋白酶K:消化组蛋白 (除去残存的酚及蛋白) 离心 ,取上层水相移至另一Ep管; (用100μl枪×?次)全取计量。 7步 TE饱合重蒸酚 8步 酚/氯仿/异戊醇(25:24:1) 9步 氯仿-异戊醇(24:1) 四、DNA的纯化 去除蛋白等 乙醇 + 盐 五、DNA的浓缩 沉淀法 10步 NaAc-- v,混匀 (离心机甩下) 10 1 11步 无水乙醇 -- 2倍v,混匀,-70℃ 15min。 (低温利于沉淀) 12步 离心,弃上清 13步 滤纸条吸残液,室温干燥 降低DNA的溶解度,稳定DNA分子 1 简化操作步骤,缩短提取过程 2 减少化学因素对核酸的降解 (pH4~10) (减少破坏因素) 3 减少物理因素对核酸的降解 4 防止核酸的生物降解 机械剪切力: 高速震荡;快速狭长孔道;反复冻溶… 高温: 常规操作温度为0~4℃ *
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