曙光天潮集群使用手册.doc

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曙光天潮集群使用手册

曙光天潮集群使用手册 --河南理工大学集群系统 曙光信息产业(北京)有限公司 二零一零年元月 目 录 1. 概述(集群介绍) 3 2. 标准硬件环境部署 4 2.1. 安装机柜 4 2.2. 机架式服务器接电介绍 6 2.2.1. 曙光机柜线槽板内部线缆示意图 6 2.2.2. 电源箱外接空气示意图 6 2.3. 机柜内部设备安装 8 2.4. 加电 8 2.4.1. 开机说明 8 2.4.2. 关机说明 8 3. 集群登录说明 10 3.1集群地址 10 3.2登陆协议 10 3.3登陆终端软件 10 3.4使用方法 10 3.4.1软件启动 10 3.4.2输入登陆地址 10 3.4.3连接集群 10 3.4.4根据提示输入用户名与密码 10 3.4.5登陆环境 11 3.5文件传输协议 11 3.6文件传输软件 11 3.7文件传输方法 11 3.7.1软件启动 11 3.7.2输入连接信息: 11 3.7.3连接test@河南理工大学 12 3.7.4登陆成功画面 13 4. 曙光SKVM系统安装配置 14 4.1安装及操作 14 4.2 SKVM的组成 14 4.3 SKVM 连接图 15 4.4 OSD菜单的使用 15 4.5 帮助菜单 15 4.6 节点选择菜单 16 4.7 节点编辑菜单 16 4.8 系统更新菜单 17 4.9 错误提示菜单 17 5. 软件环境部署 18 5.1. 操作系统安装 18 5.2. 操作系统配置 18 5.2.1. 用户设置 18 5.2.2. 机器名配置 18 5.2.3. 网络设置 18 5.2.4. RSH设置 19 5.2.5. NFS设置 19 5.2.6. SSH设置(集群中的每台机器执行以下操作) 20 5.3. 曙光机群软件Gridview安装(见安装维护手册) 21 5.4. 并行环境 21 5.4.1. 用GCC编译MPICH 21 5.4.2. 用PGI编译MPICH 22 5.4.3. 用GCC编译OPENMPI 23 5.4.4. 用PGI编译OpenMPI-1.2.5 24 5.4.5. 用Intel编译MPICH 24 5.4.6. 用Intel编译OpenMPI 25 5.5. 数学库 25 5.5.1. acml-4-1-0-nag-64bit 25 5.5.2. atlas3.6.0.gz 26 5.5.3. BLAS 28 5.5.4. GoToBlas 28 5.5.5. lapack 29 5.5.6. scalapack 30 5.6. Torque作业调度系统 33 5.6.1. 服务节点 33 5.6.2. 计算节点 34 5.6.3. 安装调试完毕后服务的自启动设置 35 5.6.4. Torque安装完后的验证 36 6 系统管理员日常工作 36 6.2 日常工作 36 6.3 权限控制 37 6.4 常用工具 38 7 常见问题 38 1. 概述(集群介绍)   依 2. 标准硬件环境部署 2.1. 安装机柜    1) 机柜主要技术指标如下: 序号 项目 技术参数 1 外形尺寸 宽600mm×深1100mm×2000mm 2 立柱可用高度 42U 3 立柱安装孔中心距 465.1±1.6mm 4 机柜并柜节距 600mm 5 机柜总承载重量 静载 800Kg 动载 350Kg 6 机柜自重 120Kg 7 前后门开孔率 前门 65% 后门 76% 8 走线孔尺寸 4*Φ83mm(顶底板各一组) 2) 机柜摆放如下图所示(以2组10个机柜为例),其要求如下: 序号 项目 要求 1 场地净高度 ≥2.6m 2 机柜间安装间距 ≤5mm 3 机柜前应留净空 ≥1.2m 4 机柜前后留净空 ≥1.2m 5 地板 铺设活动防静电地板 地板承重: 刀片服务器≥1000KG/㎡ 机架式服务器≥500KG/㎡ 活动地板距地高度≥300mm, 6 风道 机柜设计为前(装饰面)进风、后出风; 机柜前为冷风区,后为热风区; 机柜开放式设计,内部垂直方向无风压差要求 7 其它 1) 保持良好的通风并远离热源 2) 远离有倒覆可能的危险物体 3) 隔离强电磁场和产生电子噪声的电子设备,例如电梯、复印机、大功率风扇、大功率电机、广播电视发射设备、大功率高频通信设备等                                  2.2. 机架式服务器接电介绍 2.2.1. 曙光机柜线槽板内部线缆示意图   线槽板内部分为三路,分别为A红B绿C黄,中间黄绿色线缆为地线,右边蓝色线缆为零线,ABC三路各自带有自己的零线,到线槽板底部,零线合并。   如果用户使用的是单相220V电压,则用户UPS输入线槽板的电流分流三路,若用户采用三相380

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