5功能基因组学解说.pptVIP

负向调控的基因 例如，我们研究的表型是癌症，如果出现癌症，是功能获得； 对于癌症这种症状（功能）来说 P53基因的失活，反而会导致癌症的获得； P53基因对于癌症（表型）是负向调控 5.基因调控策略 1、基因增强表达 表达产物增加 2、基因下调表达 表达产物减少 问题：怎么使表达产物增加或减少呢？ 基因增强表达（锦上添花） 有两种技术可以使细胞中某一基因过量表达： 增加基因的拷贝数 采用强启动子如（35S） 基因下调表达-基因失活（减弱） （雪中送炭） 基因敲除(gene knockout) 同源重组 ZFN TALEN crispr/Cas9 基因敲减(gene knockdown) RNAi(RNA inteference) 基因敲除 将细胞基因组中某基因去除或使基因失去活性的技术。 广义的基因敲除包括某个或某些基因的完全敲除、部分敲除、基因调控序列的敲除以及成段基因组序列的敲除。 2007诺贝尔生理学医学奖获得者 英国人马丁·埃文斯、 美国人马里奥·卡佩基、 奥利弗·史密斯 他们在改造活体内特定基因的“基因靶向”技术等方面做出的奠基性贡献，而共同获此殊荣。 利用基因同源重组进行基因敲除 a.基因载体的构建 把目的基因和与细胞内靶基因特异片段同源的DNA 分子都重组到带有标记基因的载体上，成为重组载体。 利用基因敲除获得的转基因小鼠 f．得到纯合体： 由于同源重组常常发生在一对染色体上中一条染色体中,所以如果要得到稳定遗传的纯合体基因敲除模型，需要进行至少两代遗传。 RNAi 基因沉默技术：获得诺贝尔奖 放在下面一节课讲授 基因功能的实验验证离不开 PCR技术、DNA重组技术、转基因技术、 印迹杂交技术等。 * * * 第五章 功能基因组学 基因组学 基因组学可以分为结构基因组学和功能基因组学 对基因组物理结构的作图和测序的研究称为结构基因组学； 结构基因组学 功能基因组学 后基因组时代 ( Postgenome era) * 人类基因组计划完成之后，生物学被重新划分为前基因组和后基因组两部分。 * 科学研究已开始进入“后基因组时代”。主要是开展蛋白质组的研究。 * 有科学家形象地说道：即使基因测序全部完成，也只好像是一本没有姓名、只有号码的电话簿。“后基因组时代”的最终目标，是要把深奥的DNA语言变成一本基因大百科全书。 后基因组学时代 做什么？ 怎么做？ 后基因组学时代要做的工作： 1、如何将人类基因组计划所获知的人类基因序列转变为对人类自身奥秘的认识？ 2、如何对这些基因加以利用？ 做什么？达到什么目的？ 功能基因组学将成为新世纪最大战略资源—人类基因资源夺战的重要“战场” 。 功能基因组学 目标： 基因的识别、鉴定、克隆 基因功能及其相互关系 基因表达调控的研究 功能基因组学 后基因组学(Post genomics)：利用结构基因组学提供的信息和产物，通过在基因组系统水平上全面分析基因组表达与调控研究、基因功能 功能基因组学 任务： 是对成千上万的基因表达进行分析和比较，从基因组整体水平上阐述基因活动的规律。 怎么做？ 基因组测序之前： 一个一个地研究，“零敲碎打” 基因组测序之后： 成千上万个基因同时研究，还要横向比较分析（互作） CREDIT: JOE SUTLIFF Science, Vol 291: 1221. Fishing in a More Effective Way! 功能基因组学优势： 1）使得生物学研究从对单一基因与蛋白质的研究转向对基因组与蛋白质组的系统研究 2）对成千上万的基因表达进行分析和比较，从基因组整体水平上对基因的活动规律进行阐述 特别是对家族基因和家族蛋白的研究 基因功能研究的步骤 1.下载基因组序列 2.分析基因结构 生物信息学方法 3.预测基因功能 4.验证基因功能 转基因技术 1.下载基因序列 登陆NCBI（上网演示） 大的Contig可以切成更小的Contig 2、分析基因结构 （1）生物信息学预测基因结构 （2）预测结构与该基因的EST比较 （3）获知该基因的结构 生物信息学预测基因的结构 用Fgenesh在线预测基因（上网演示） 获知该基因的CDS 再结合该基因cDNA 得出基因的结构 分析基因结构-生物信息学分析 查找开放阅读框（open reading frame, ORF） 开放阅读框都有一个起始密码子ATG，还要