[南京农业大学][生物信息]3生物信息学的生物学基础解说.ppt

普通生物学 细胞 遗传 进化 分子生物学 —— 研究核酸、蛋白质等生物大分子的结构、功能和相互关系 —— 研究生物大分子在生命活动中的重要性、规律性，从分子水平上真正揭开生物世界的奥秘 生物信息学 原 核 细 胞 真 核 细 胞 真 核 细 胞 真 核 细 胞 真 核 细 胞 细 胞 核 细 胞 膜 细 胞 器 真 核 细 胞 的 分 裂 真 核 细 胞 蛋白质 20种标准氨基酸 20种标准氨基酸 细胞 蛋白质 核酸 研究手段 细胞 蛋白质 核酸 研究手段 蛋白质 蛋白质的结构 蛋白质的二级结构 （secondary structure ） 二级结构主要有以下几种形式： （i）?螺旋 （ii）?折叠 – 平行折叠 反平行折叠 （iii）?转角 – 连接作用”U”型结构（大多Phe, Gly组成） （iv）无规卷曲-没有确定规律性的肽链构象，但仍是紧密有序的稳定结构 （v）无序结构 多肽链中有６０％的区段为?螺旋和?折叠 蛋白质 蛋白质的结构 ?螺旋 肽链主链骨架围绕中心轴盘旋成螺旋状的结构。 蛋白质 蛋白质的结构 ?折叠 在多肽链之间或一条肽链的肽段之间靠氢键联结 而成的锯齿状片层结构 蛋白质 蛋白质的结构 ?转角 在球状的蛋白质分子中，肽链经常出现的回折， 由4个连续的氨基酸组成。（大多Phe, Gly组成） 蛋白质 蛋白质的结构 蛋白质的三级结构 在二级结构基础上的肽链再折叠形成的构象 α螺旋 β折叠 Zn 疏水核心 α螺旋 蛋白质 蛋白质的结构 蛋白质的四级结构 组成蛋白质的多条肽链在天然构象空间上的排列方式，多以弱键互相连接。疏水力、氢键、盐键 蛋白质 蛋白质结构与功能的关系 一级结构 即氨基酸顺序 高级结构 生物学功能 （1）蛋白质一级结构与功能的关系 序列分析 （2）蛋白质空间构象与功能的关系 结构分析 核酸 核酸的化学结构 碱基+戊糖 核苷 + 磷酸 核苷酸 聚合 核酸 碱基 戊糖 磷酸 任意碱基 G or A or T or C N 非C G or A or T D 非T(非U) G or C or A V 非A G or T or C B 非G A or C or T H 弱氢键（2个氢键） A or T W 强氢键（3个氢键） G or C S 酮基 G or T K 氨基 A or C M 嘧啶 T or C Y 嘌呤 G or A R 胞嘧啶 C C 胸腺嘧啶 T T 腺嘌呤 A A 鸟嘌呤 G G 说 明 含 义 符 号 扩展的遗传学字母表或IUPAC编码 核酸 DNA的一级结构 （1）DNA的碱基组成 （i） A=T , G=C （ii） A+G=C+T （2）DNA的一级结构 由A、T、C、G四种脱氧核苷酸通过3‘、5’-磷酸二酯键连接而成的长链高分子多聚体为DNA分子的一级结构 核酸 RNA和核糖体 RNA是单链分子,RNA主要有三种 : 信使RNA（mRNA）- 转录遗传信息 核糖体RNA（rRNA）- 蛋白质合成 转运RNA（tRNA）- 转运氨基酸 核糖体是蛋白质合成的场所，核糖体主要由蛋白质分子和rRNA组成 核酸 RNA和核糖体 反密码子 氨基酸 新生肽链 核糖体 mRNA mRNA， tRNA，rRNA tRNA 16S rRNA可识别mRNA起始位点 核酸 遗传密码的基本特征 密码无标点符号 密码的简并性（degeneracy） 特殊密码子 核酸 中心法则 复制 DNA 转录 逆转录 复制 RNA 蛋白质 翻译 调控 核酸 基 因 基因具有几个重要的特征： 基因是一种相对独立的遗传信息单位； 基因是一段DNA分子，遗传信息贮存在DNA中； 基因通过指导合成蛋白质或RNA，进而产生生理功能，或影响其他基因的表达。 核酸 基 因 原核生物基因的转录： i A Y Z o p 操纵子模型 结构基因 调节基因 操纵基因 操纵子 核