[南京农业大学][生物信息]11解说.ppt

生物信息学的应用 (商业)生物信息学市场规模： 生物学背景？★★★ 分子生物学／基因工程 数学？★ 统计学，模型，算法 计算机科学背景？ ★ 　 Linux/Perl/PHP/JAVA/C++/Visual Basic 生物信息学？－－新兴的交叉学科 So, 采用信息科学技术，借助数学、生物学的理论、方法，对各种生物信息（包括核酸、蛋白质等）的收集、加工、储存、分析、解释的一门学科。 收集、加工、储存：计算机科学家 分析、解释：生物学家 生物信息学的学习人员： 1）学习生物信息学是为了发展生物信息学 —— 计算机科学家 2）学习生物信息学是为了应用生物信息学 —— 生物学家 我们属于…… Course content 生物信息学的资源 生物信息学的工具 生物信息学的原理 生物信息学的分析思路 生物信息学软件的编写 能够学有所用是根本！多练习 References 孙啸等，生物信息学基础，清华大学出版社，2005★★ 张成岗等．生物信息学方法与实践，科学出版社，2002★★ 黄韧等。生物信息学——网络资源与应用，中山大学出版社，2003 钟扬等．简明生物信息学，高等教育出版社，2001 其他 第一章生物信息学引论 生物信息学的应用 –医学 新药物设计 基因芯片疾病快速诊断 流行病学研究：SARS 人类基因组计划 寄生虫基因组计划：基因芯片 人类基因组与其它生物基因组比较 引言 通过国际合作，用15年时间(1990～2005)至少投入30亿美元，构建详细的人类基因组遗传图和物理图 ，确定人类DNA的全部核苷酸序列，定位约10万基因，并对其它生物进行类似研究。 HGP的终极目标 阐明人类基因组全部DNA序列； 识别基因； 建立储存这些信息的数据库； 开发数据分析工具； 研究HGP实施所带来的伦理、法律和社会问题。 HGP目标 引言 我国自主产权的全基因组测序计划 引言 水稻 (2002) 家鸡 (2004) 家蚕 (2007) 家猪 (启动) 大熊猫 (启动) 又一次成功！ ——水稻基因研究 引言 GCCATGGCGGCCGCGGGAATTCGATTTTGAGAGTGAGCATTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTACGGCTTAATTTGACCCAACACGGGGAAACTTACCAGGTCCAGACATAGTAAGGATTGACAGACTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGCTATGTGGAGGTAACCCTCCACGGCCAGCTTCTTAGAGGGACTATGGCCGCTTAGGCCACGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTTCACTGATGTATTCAACGAGTCTATAGCCTTGGCCGACAGGTCCGGGTAATCTTTGAAATTTCATCGTGATGGGGATAGATCATTGCAATTGTTGGTCTTCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGACTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGGTCCGGTGAAGTGTTCGGATTGCGGCGACGTGAGCGGTTCGCTGCCCGCGACGTTGTGAGAAGTCCACTGAACCTTATCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGATGCCTCACAATCAGATTGACCCGCGTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAATCACTAGTGAATTCGCGGCCGCCTGCAGGTCGACCATATGGGAGAGCTCCCAACGCGTTGGATGCATAGCTTGAGTATTCTATAGTGTCACCTAAATAGCTTGCGTATCATGTCATAGCTGTTTCCTGGTGTGAATTGTTATCCGCCTCACAATTCACAGGCGGCGGCCGCGGGAATTCGATTTTGAGAGTGAGCATTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGC