蛋白质结构讲义.ppt

蛋白质的结构分为： 一级结构、二级结构、三级结构、四级结构。 在二、三级结构间划分出超二级结构和结构域。 五、 蛋白质的构象和维持构象的作用力 p40-41 构型（configuration):立体异构体分子中取代原子或 基团在空间的取向，如几何异构体和旋光异构体。 构型互变需要共价键的断裂。 构象(conformation)：取代基团当单键旋转时形成不同 的立体结构。 构象有无数种，交叉型最稳定，重叠型最不稳定。 构象互变不需要共价键的断裂。 本章后续…… 又称β-弯曲，β-回折或发夹结构。指蛋白质的多肽链在形成空间构象时经常会出现180。的回折，回折处的结构就称为β-转角。 一般由四个连续的氨基酸组成，第一个氨基酸的羧基与第四个氨基酸的氨基形成氢键。也有一些是由第一个氨基酸的羧基与第三个氨基酸的氨基形成氢键。 (3) β-转角 ——泛指不能归入明确的二级结构 如折叠片和螺旋的多肽片断。 （4）无规卷曲（random coil） 2.3.3 超二级结构和结构域 1．超二级结构 超二级结构（Super-secondary structure）的概念是M.Rossmann于1973年提出来的。蛋白质分子中的多肽链在三维折叠中往往形成有规则的二级结构聚集体，在球蛋白中充当三级结构的构件。常见的有：αα、ββ、βαβαβ等。 2．结构域（structural domain） 在一些相对较大的蛋白质分子中，在空间折叠时往往先分别折叠成几个相对独立的区域，再组装成更复杂的球状结构，这种在二级或超二级结构基础上形成的特定区域称为结构域。它的结构层次介于超二级结构和三级结构之间。如图所示： * * 蛋白质的结构 2.3.1 蛋白质的一级结构 2.3.2 蛋白质的二级结构 2.3.4 蛋白质的四级结构 2.3.3 蛋白质的三级结构 【主要内容】： §2.3 蛋白质的分子结构 蛋白质的一、二、三、四级结构 2.3.1 蛋白质的一级结构 一、蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构（Primary structure）又称为共价结构或化学结构。 是指蛋白质中氨基酸的排列顺序。 （一）肽键与肽链 1.肽键：一个氨基酸的α-COOH 和相邻的另一个氨基酸的 α-NH2脱水形成共价键。如下图： 肽键和肽的结构 2. 氨基酸借肽键连接起来叫肽； 1）两个氨基酸组成的肽叫二肽；2）三个氨基酸组成的肽叫三肽； 3）多个氨基酸组成的肽叫多肽； 4）氨基酸借肽键连成长链，称为肽链，肽链两端有 自由-NH2和-COOH，自由-NH2端称为N-末端（氨基末端）， 自由-COOH端称为C-末端（羧基末端）；5）构成肽链的氨基酸已残缺不全，称为氨基酸残基；6）肽链中的氨基酸的排列顺序，一般-NH2端开始，由N指 向C，即多肽链有方向性，N端为头，C端为尾。 （二）天然活性肽 (了解) 自然界中有自由存在的活性肽，主要有： 1. 谷胱甘肽（GSH）：三肽（Glu-Cys-Gly），广泛存在于生物细胞中，含有自由的巯基，具有很强的还原性，可作为体内重要的还原剂，保护某些蛋白质或酶分子中的巯基免遭氧化，使其处于活性状态。 2.促甲状腺素释放激素：三肽（焦谷氨酰组氨酰脯氨酸），可促进甲状腺素的释放。 3.短杆菌素S：环十肽，含有D-苯丙氨酸、鸟氨酸，对革兰氏阴性细菌有破坏作用，主要作用于细胞膜。 4.青霉素：含有D—半胱氨酸和D—缬氨酸的二肽衍生物 。主要破坏细菌的细胞壁粘肽的合成引起溶菌。 5.牛催产素与加压素：均为九肽，分子中含有一对二硫键，两者结构类似。前者可刺激子宫的收缩，促进分娩。后者可促进小动脉收缩，使血压升高，也有抗利尿作用，参与水、盐代谢的调节。 牛催产素 : S S Cys·Tyr·Ile·Gln·Asn·Cys·Pro·Leu·Gly-NH2 牛加压素 : 7.脑啡肽：为五肽，具有镇痛作用。 S S Cys·Tyr·Phe·Gln·Asn·Cys·Pro·Ary·Gly-NH2 6.舒缓激肽：促进血管舒张，促进水、钠离子的排出。 （三）蛋白质的一级结构研究 一级结构的研究包括：蛋白质的氨基酸组成测定，肽链数目的确定，末端氨基酸种类测定，氨基酸的排列顺序测定，二硫键位置的测定，酰胺位置的确定。大致步骤如下： 1.获取一定量纯的蛋白质样品，测其分子量，然后将样品完全水解，确定该蛋白质的氨基酸种类、数目及每种氨基酸的含量。 2.进行末端测定，确定该蛋白质的肽