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人工基因组的设计与合成;中心法则;温故 知新;第六章 基因表达调控(二);第六章 基因表达调控;根据其性质可分为两大类:;真核生物基因组结构特点;真核基因表达调控的层次;真核生物基因表达调控的层次
1、DNA水平调节
2、 转录水平调节
3、转录后水平的调节
4、翻译水平调节
5、翻译后加工的调节
; 真核生物DNA水平上的基因表达调控;基因丢失:; 出生日期:1996年7月5日
出生地点:英国爱丁堡市罗斯林研究所
死亡日期:2003年2月14日
死亡原因:被确诊患进行性肺病后处以安乐死
创造者:伊恩·维尔穆特及其领导的小组
基因父亲:无
基因母亲:一只芬兰多塞特白面绵羊
线粒体母亲:一只苏格兰黑脸羊
生育母亲:另一只苏格兰黑脸羊
子女:生育6名,存活5名;基因扩增:;基因组拷贝数增加,即多倍性,在植物中是非常普遍的现象。基因组拷贝数增加使可供遗传重组的物质增多,这可能构成了加速基因进化、基因组重组和最终物种形成的一种方式。;多倍体的DNA含量与组织的成熟程度成正比。对于一给定的物种,C是单倍体基因组中的DNA质量。;将一个基因从远离启动子的地方移到距它很近的位点从而启动转录,这种方式被称为基因重排。
通过基因重排调节基因活性的典型例子是免疫球蛋白结构基因的表达。;;;DNA的甲基化状态:;甲基化酶:
1、维持性甲基化酶(日常型甲基化酶):
在DNA复制时, 可识别新合成的半甲基化双链,并将甲基加到新链的非甲基化胞嘧啶上;
2、从头合成型甲基化酶:
不需要甲基化的DNA 模板作指导,可以直接使非甲基化的DNA 甲基化; 原核细胞的DNA甲基化;2、Dam甲基化
(1)DNA腺嘌呤甲基化酶:识别序列GATC
(2)作用:
a、错配修复:识别母链,修正子链
b、转录调节:如抑制转座酶基因的转录,
抑制转座;真核细胞DNA 甲基化;(3)CpG岛:
富含CpG的一段DNA,一般位于基因启动子附近
特点:
a、1~2kb;
b、位于基因5’端;
c、富含CpG二核苷酸基序
;在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出现在CpG序列、CpXpG、CCA/TGG和GATC中 ;2、甲基化的作用:
(1)基因表达调控的一种方式
(2)抑制外源基因的表达
(3)抑制转座子、反转座子的活动;3、DNA甲基化与基因表达调控
基因表达与甲基化呈负相关
DNA甲基化转录抑制作用机理
(1)识别位点中胞嘧啶被甲基化,转录因子不能
与其结合
(2)特异性识别甲基化DNA的蛋白(如MeCP1)
竞争性地抑制了转录因子的结合
(3)DNA甲基化导致染色质结构和DNA构象的改变;4、DNA甲基化与基因组印迹
(1)基因组印迹:来源于父母本的一对等位基因
表达不同(如X染色体失活)
(2)基因组印迹的机制--DNA高度甲基化 ;染色质结构影响基因转录
常染色质(euchromatin)---基因可以转录,也称活性染色质
异染色质(hetrochromatin)---基因不能转录
活性基因置于异染色质内会失活
位置效应(Position effect) :指基因转移到基因组上新位置而引起基因表达的改变;异染色质化:基因组某些区域 被组装成高度压缩的异染色质的过程
巴氏小体:哺乳类雌体细胞1条X染色体异染色质化 (雌性X染色体基因表达的蛋白质可能是雄性的两倍)
剂量补偿:女性两条X染色体的作用与男性一条X染色体基因产物剂量平衡的现象 ;活性染色质的主要特点;活性染色质上具有DNaseI超敏感位点。每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感位点,大部分位于基因5′端启动子区域。;活性染色质上具有核基质结合区( matrix attachment region ,MAR)。MAR一般位于DNA放射环或活性转录基因的两端。
DNA放射环:由直径为25~30 nm的DNA纤丝放射状折叠排列成约250 nm左右的染色单体丝。
在外源基因两端接上MAR,可增加基因表达水平10倍以上,说明MAR在基因表达调控中有作用。是一种新的基因调控元件。;;真核转录水平的调控;反式作用元件的结构; 转录因子DNA结合域
几种常见基序
锌指(zinc finger)
螺旋-转角-螺旋 (helix- turn- helix)
二聚体结构域:
螺旋-环-螺旋 (helix- loop- helix,HLH )
亮氨酸拉链 (Leucine zipper)
;锌指(zinc
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