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单细胞测序技术; 过去二十几年里,随着基因测序技术水平的提高以及千人基因组计划、癌症基因组计划等重大国际合作项目的相继开展,基因组研究日渐被推向高潮。
我们能够得到全基因组序列信息,但是对其进行研究得到的结果只是一群细胞中信号的平均值,或者只代表其中占优势数量的细胞信息,单个细胞独有的特性被忽视。另外有些样品稀少无法在实验室培养,样品量不足以进行全基因组分析,因此全基因组测序遇到难题。
; 单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两方面,分别针对单个细胞的DNA和RNA进行序列分析和比较,进而揭示基因组和转录组的变化。;
优势:
1.测量基因表达水平更加精确;
2.能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA
需要克服的难题:
1.如何实现均匀扩增;
2.全基因组覆盖问题;
3.较高的扩??效率。
; MALBAC技术,首先需要进行5轮MDA预扩增,然后就可以使新获得的扩增产物形成闭合的环状分子。由于这些环状分子不能够被进一步扩增,所以整个扩增过程就变成了线性扩增。然后再进行常规的PCR扩增,由于此时采用的模板更加均一,所以在进行PCR扩增时就不易造成较大的差异。;基因组模板DNA;;;;;;第二个要解决的难题,这里是利用Phi29聚合酶能一次在模板上聚合出多个新链的功能来达到这个目的。在5轮的扩增之后,每个模板都会有5*n2个扩增片段,这样就可以保证建库时大多数的基因组区域可以被建成文库,最后可以被测序测到。
;MDA方法的技术核心是用Phi29DNA聚合酶来进行直接的扩增,Phi29DNA聚合酶可以把双链DNA进行解链,然后在常温条件下就把原始模板进行大量扩增;MDA的特点:
扩增效率更高,实验方法简单
MALBAC的特点:
扩增均一性更好;
得到的扩增DNA的量相对较少,或者说他的扩增效率相对较低;应用;在有习惯性流产的夫妇当中,最常见的病因就是染色体的平衡易位,所谓染色体平衡易位也就是A染色体的一段移到了B染色体上;请大家批评指正!
谢谢!
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