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章核酸分析
碱基 戊糖 磷酸 嘌呤 嘧啶 DNA A G C T 脱氧核糖 磷酸 RNA A G C U 核糖 磷酸 N9 N1 C-1’ 核苷 糖苷键 核苷酸(多为5’核苷酸) 磷酸酯键 两种核酸的比较 二、核苷酸的连接方式 DNA和RNA都是通过核苷酸间的3,5-磷酸二酯键连接而成,即前一个核苷酸的C3-OH与下一核苷酸的C5位磷酸之间脱水形成酯键。 核苷酸的连接具有严格的方向性。通过3,5-磷酸二酯键连接形成的核酸是一个没有分支的线性分子,它们的两个末端分别为5末端(游离磷酸基)和3末端(游离羟基),书写方向应该从5→3。 核苷酸之间的连接具有严格的方向性:5’ 3’核酸大小以碱基数表示 核酸的结构简式 A G T G A G T G 葡萄糖有4个手性C,每个C都可形成D-和L-两种构象,但习惯上规定以离羰基最远的手性C的构象作为判断葡萄糖D-或L-型的标准 L-(+)-葡萄糖 H OH 直立环式右侧的羟基,在哈沃斯式中处在环平面下方;直立环式中左侧的羟 基,在环平面的上方。C-1上新形成的半缩醛羟基在环平面下方者为α型;在环平面上方者称为β型。 * 第二章 核酸的结构与功能(Nucleic acids) 本章纲要: 核酸的定义、分类及化学组成 核酸的基本单位-核苷酸的组成特点 掌握DNA一级结构、二级结构、核小体、DNA功能 RNA的种类、结构和功能 熟悉核酸重要的理化性质,掌握核酸的变性、复性、分子杂交。核酸的紫外吸收性质 了解核酸催化性质 决定生物体遗传特征,担负生命信息的贮存和传递的生物大分子。 知识点 核酸的种类 脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA) ——遗传信息的贮存和携带者 核糖核酸(ribonucleic acid,RNA) ——参与遗传信息的表达 第一节 核酸的基本组成单位—核苷酸 基本组成单位:核苷酸 知识点 知识点 图1-1 核酸的构成 核酸的基本组成单位是核苷酸 核苷酸则由碱基(base)、核糖(ribose)或脱氧核糖(deoxyribose)、磷酸三种成分通过共价键连接而成。 一、核苷酸的组成 (一)碱基 DNA:A、G、C、T RNA: A、G、C、U 组成核酸 的碱基 腺嘌呤(A) 鸟嘌呤(G) 胞嘧啶(C) 胸腺嘧啶(T) DNA 尿嘧啶(U) RNA 表2-1 核酸中的部分稀有碱基 DNA RNA 嘌呤 7-甲基鸟嘌呤(m7G) N6-甲基腺嘌呤(m6A) N6-甲基腺嘌呤(m6A) N 6, N 6-二甲基腺嘌呤 7-甲基鸟嘌呤 嘧啶 5-甲基胞嘧啶(m5C) 5-甲基胞嘧啶(m5C) 5-羟甲基胞嘧啶(hm5C) 5-羟甲基胞嘧啶(hm5C) 碱基的互变异构 嘌呤和嘧啶碱基都是含氮杂环化合物,分子中的酮基或氨基均位于杂环上氮原子的邻位,受介质中pH的影响,会发生酮式-烯醇式互变异构,或氨基-亚氨基互变异构 酮式-烯醇式 氨式-亚氨式 碱基的紫外吸收性质 嘌呤环和嘧啶环中含有共轭双键,因而都有吸收紫外光的性质,吸收高峰在波长260nm左右。 (二)戊糖 构成核苷酸的戊糖有两种,DNA分子中含有β-D-2脱氧核糖,RNA分子中的戊糖为β-D-核糖。碱基杂环中的原子编号一般以1,2,3,……表示,为了与此区分开来,糖环上的碳原子则标以1,2,3等 。 (三)核苷与核苷酸 碱基与戊糖通过β-N-糖苷键(β-N-glycosidic bond)缩合形成核苷(nucleoside) 嘌呤类核苷是由嘌呤环上的N-9与戊糖的C-1‘连接,嘧啶类核苷是由嘧啶环上的N-1与戊糖的C-1相连。 核苷的戊糖羟基与磷酸之间脱水以酯键相连(即形成磷酸酯键),即为核苷酸。最常见的酯化部位是在核糖或脱氧核糖的C-5和C-3位上。单核苷酸分子中的磷酸主要连接在C-5位上,称为5-核苷酸。 H 腺苷酸的结构(AMP) 表2-2 构成DNA及RNA的碱基、核苷和核苷酸 碱基 核苷 核苷酸 DNA 腺嘌呤 脱氧腺苷 脱氧腺苷酸 (adenine, A) (deoxyadenosine) (deoxyadenosine monophosphate, dAMP) 鸟嘌呤 脱氧鸟苷 脱氧鸟苷酸 (g
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