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二、蛋白质的二级结构 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。 稳定因素: 氢键 蛋白质二级结构的主要形式 ?-螺旋 ( ? -helix ) ?-折叠 ( ?-pleated sheet ) ?-转角 ( ?-turn ) 无规卷曲 ( random coil ) (一) ?-螺旋 结构要点: ①多肽链主链围绕中心轴形成 右手螺旋,侧链伸向螺旋外侧。 ②每圈螺旋含3.6个氨基酸,螺距为0.54nm。 ③每个肽键的亚氨氢和第四个肽键的羰基氧形成的氢键保持螺旋稳定。氢键与螺旋长轴基本平行。 (三)?-折叠 ①多肽链充分伸展,相邻肽单元之间折叠成锯齿状结构,侧链位于锯齿结构的上下方。 ②两段以上的β-折叠结构平行排列 ,两链间可顺向平行,也可反向平行 。 ③两链间的肽键之间形成氢键,以稳固β-折叠结构。氢键与螺旋长轴垂直。 (四)?-转角和无规卷曲 ?-转角: 无规卷曲:没有确定规律性的肽链结构。 ① 肽链内形成180o回折。 ② 含4个氨基酸残基,第一个 氨基酸残基与第四个形成氢键。 ③ 第二个氨基酸残基常为Pro。 三、蛋白质的三级结构 疏水键、离子键、氢键和 范德华力等。 稳定因素: 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 如:肌红蛋白 (Mb) 结构域 (domain) 大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行其功能,称为结构域。 亚基之间的结合力主要是氢键和离子键。 四、蛋白质的四级结构 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。 每条具有完整三级结构的多肽链,称为亚基 (subunit)。 血红蛋白(Hb)的四级结构 蛋白质结构与功能的关系 第 三 节 (一)一级结构是空间构象的基础 一、蛋白质一级结构与功能的关系 牛核糖核酸酶的一级结构 二硫键 天然状态,有催化活性 尿素、β-巯基乙醇 去除尿素、 β-巯基乙醇 非折叠状态,无活性 (二)一级结构与功能的关系 例:镰刀形红细胞贫血 N-Val · His · Leu · Thr · Pro · Glu · Glu · · · · ·C(146) HbS β 肽链 HbA β 肽 链 N-Val · His · Leu · Thr · Pro · Val · Glu · · · · ·C(146) 这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病,称为“分子病”。 (一)肌红蛋白与血红蛋白的结构 二、蛋白质空间结构与功能的关系 Hb与Mb一样能可逆地与O2结合, Hb与O2结合后称为氧合Hb。氧合Hb占总Hb的百分数(称血氧饱和度)随O2浓度变化而改变。 (二)血红蛋白的构象变化与结合氧 * 第 二 章 蛋白质的结构与功能 Structure and Function of Protein 概 述 蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。 (一)蛋白质的概念: (二)蛋白质的生物学作用 1. 蛋白质是生物体的重要组成成分 2. 蛋白质具有重要的生物学功能 1)作为生物催化剂 2)代谢调节作用 3)免疫保护作用 4)物质的转运和存储 5)运动与支持作用 6)参与细胞间信息传递 3. 氧化供能 蛋白质的分子组成 第 一 节 一、蛋白质的元素组成 主要有C、H、O、N和S。 有些蛋白质含有少量P或金属元素Fe、Cu、Zn、Mn、Co、Mo,个别蛋白质还含有 I 。 蛋白质的含氮量平均为16%。 蛋白质含量 ( g % ) = 含氮量( g % ) × 6.25 二、氨基酸 —蛋白质的基本组成单位 存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属 L-?-氨基酸(甘氨酸除外)。 H 甘氨酸 CH3 丙氨酸 L-氨基酸的通式 R 非极性疏水性氨基酸 极性中性氨基酸 酸性氨基酸 碱性氨基酸 (一)氨基酸的分类 非极性疏水性氨基酸 2. 极性中性氨基酸 3. 酸性氨基酸 4. 碱性氨基酸 习惯分类方法 芳香族氨基酸:Trp、Tyr、Phe 含羟基氨基酸:Ser、Thr、Tyr 含硫氨基酸:Cys、Met 杂环族氨基酸:His 杂环族亚氨基酸:Pro 支链氨基酸:Val、Leu、Ile 氨基酸趣味记忆法 氨基酸真难记 要记先记疏水侧 亮亮缬丙甘, 苯丙脯色蛋; 中极侧链氨基酸 丝苏酪半双酰胺;
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