第13章核酸的结构分析.pptxVIP

第13章 核酸的结构; 核苷酸 核酸的共价结构 DNA的高级结构 RNA的高级结构; ;;;稀有碱基;G+核糖 G+脱氧核糖 C+核糖 RNA A+脱氧核糖 DNA U+核糖 T+脱氧核糖;核苷或脱氧核苷与磷酸通过酯键结合构成核苷酸(ribonucleotide)或脱氧核苷酸(deoxyribonucleotide)。;9;Adenosine 5? -monophosphate (AMP);环化核苷酸：cAMP、cGMP，是细胞信号转导中的第二信使。;12;AMP、ADP、ATP GMP、GDP、GTP CMP、CDP、CTP UMP、UDP、UTP; ;;5? end;T;18;原核生物：多顺反子（polycistronic mRNA) 真核生物：单顺反子，断裂基因（splited gene);真核生物mRNA结构特点;5? -5? ;三、DNA的高级结构; Franklin的X衍射照片显示DNA是双链并呈螺旋分子。;minor groove; 稳定因素： 氢键：维持双螺旋横向稳定 碱基堆积力：维持纵向稳定;碱基互补配对;稳定双螺旋结构的因素 ① 碱基堆积力形成疏水环境（主要因素）。 ② 碱基配对的氢键。GC含量越多，越稳定。 ③ 磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键，中和了磷酸基上的负电荷间的斥力，有助于DNA稳定。 ④ 碱基处于双螺旋内部的疏水环境中，可免受水溶性活性小分子的攻击。;DNA的双螺旋结构的意义;;;?三股螺旋DNA K. Hoogsteen 1963年;第三股与寡嘌呤之间同向平行，并按Hoogsteen配对。 ; DNA三股螺旋结构常出现在DNA复制、转录、重组的起始位点或调节位点，如启动子区。 第三股链的存在可能使一些调控蛋白或RNA聚合酶等难以与该区段结合，从而阻遏有关遗传信息的表达。;（三）DNA的三级结构;超螺旋;L=25,T=25,W=0;37;①连环数（linking number , L） DNA双螺旋中，一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数 ②扭转数（twisting number , T） DNA分子中的Watson-Crick螺旋数目，以T表示 ③超螺旋数（缠绕数 , writhing number , W）;④比连环差（specific linking difference , λ） 表示DNA的超螺旋程度(Superhelix density) λ=（L—L0）/L0 = 每一圈初级螺旋（10bp，360°）出现超螺旋数 L0是指松驰环形DNA的L值;拓扑异构酶 改变DNA拓扑异构体的L值。 ①拓扑异构酶酶I（解旋酶） 能使双链负超螺旋DNA???变成松驰形环状DNA，每次催化使L值增加1。 ②拓扑异构酶酶II（促旋酶） 能使松驰环状DNA转变成负超螺旋形DNA，每次催化使L减少2。; ; ; 所有细菌、某些病毒以及真核细胞中的线粒体或叶绿体中的DNA都是环形分子。;DNA超螺旋结构形成的意义;（四）DNA与蛋白质复合物的结构;1. 病毒;动物病毒切面模式图;细菌拟核（nucleoid ）的突环结构;3. 真核生物的染色体;;四、RNA的高级结构;酵母tRNA Ala 的二级结构;tRNA三级结构;54;tRNA的高级结构;转运氨基酸 识别密码子 参与翻译起始 参与DNA的反转录 参与基因表达调控;细菌： 16S rRNA 、5S rRNA、23S rRNA组成30S转录单位 真核：18SrRNA、 5.8S rRNA，28S rRNA组成45S的转录单位，5S rRNA单独转录。 rRNA的功能： 组成核糖体 催化肽键形成的转移酶活性存在于23SrRNA上 参与tRNA与mRNA的结合;16SrRNA;核糖体的组成;60