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第4章蛋白质折叠资料

第四章 蛋白质的折叠;蛋白质折叠的定义; 蛋白质折叠问题是生命科学领域的前沿课题之一,并且被列为“21世纪的生物物理学”的重要课题,它是分子生物学中心法则尚未解决的一个重大生物学问题。从一级序列预测蛋白质分子的三级结构并进一步预测其功能,是极富挑战性的工作。研究蛋白质折叠 ,尤其是折叠早期过程,即新生肽段的折叠过程是全面的最终阐明中心法则的一个根本问题。;蛋白质折叠研究的背景 ;第二遗传密码;完整的提法应该是遗传密码的第二部分,即蛋白质中氨基酸序列与其空间结构的对应关系,国际上称之为第二遗传密码或折叠密码。;第二遗传密码的特点;简并性的证据;多意性;全局性;破译“第二遗传密码”正是“蛋白质结构预测”从理论上最直接地去解决蛋白质的折叠问题,这是蛋白质研究最后几个尚未揭示的奥秘之一。 ;蛋白质折叠的研究内???;蛋白质折叠研究的概况;经典的蛋白质折叠自组装学说;SH;随机重组:8个SH形成4个二硫键的概率是: 1/7×1/5×1/3=1/105 核糖核酸酶不仅重新折叠了,而且选择了105种可能方式中正确的一种。 ;60年代,Anfinsen提出氨基酸序列决定了蛋白质特定三维空间结构的著名假说。; 细胞内新合成的多肽链,在其合成终了之后,不需要别的分子的帮助,也不需要额外能量的补充,就应该能够自发地折叠而形成它的三维结构。 ——所谓翻译后的自发折叠过程。;蛋白质折叠机制的理论模型;与大量现代实验相矛盾;新生肽链的折叠的新观点:; 2、细胞内新生肽链的折叠和成熟为功能蛋白,一般来说是需要帮助的,而不是自发的。 一类新的生物功能的蛋白,能够帮助细胞内的其它蛋白折叠;蛋白质的体外折叠与体内折叠;帮助新生肽折叠的蛋白(辅助蛋白);分子伴侣-蛋白质的保姆 ;分子伴侣概述;几点说明:;2)分子伴侣的作用 通过催化的或非催化的方式,加速或减缓组装过程; 传递组装所需要的空间信息; 也可能只是抑制组装过程中不正确的副反应;; 3)分子伴侣一定不是最终组装完成的结构的组成部分 一些蛋白酶的前导序列及核糖体蛋白的泛尾肽——分子内分子伴侣;4)分子伴侣帮助正确的“非共价组装”,排除共价修饰酶. 5)不仅帮助新生肽链的折叠,还帮助新生肽成熟为活性蛋白,包括转运、越膜定位、亚基组装等。 最大一类蛋白为热激蛋白(Hsp60,Hsp70, Hsp90 ) ;到底非天然构象的什么特征能被分子伴侣识别呢? 确切的原因还未知,目前只知道在天然构象中,疏水残基多半位于分子的内部而形成疏水核,去折叠后就可能暴露出来,或者在新生肽段的折叠过程中,会暂时形成在天然构象中本应该存在于分子内部的疏水表面,因此认为分子伴侣最有可能是与疏水表面相结合。;分子伴侣的类型 ;HSP40(DnaJ);HSP40(DnaJ);HSP40与HSP70相互作用示意图;Hsp70作为一种重要的内源性保护因子,可提高肺组织对各种损伤的耐受性。肺组织中Hsp70表达的增加可减轻肺水肿及炎性反应,减少肺组织细胞凋亡,从而改善氧合功能,降低病死率。 增加心脏组织中Hsp70基因的表达,可使心脏具有抵抗缺血或内毒素损伤的作用;近几年 ,有关Hsp70的研究已成为分子生物学的一大热点,并逐渐成为临床多种疾病治疗的新途径。由于Hsp能够对各种形式的组织细胞损伤提供保护作用,随着研究的深人,应用药物或基因工程等技术诱导Hsp作为肺损伤的治疗方法颇具前景。;GroEL (HSP60)型伴侣素;GroEL的立体结构图;;在未结合和结合GroES时GroEL结构域的重排;结合了ATP和GroES 的GroEL;GroEL/GroES系统促进蛋白质折叠过程 ;折 叠 酶;折叠酶类型;蛋白二硫键异构酶 (protein disulfide isomerases,PDI);细菌中含有二硫键蛋白质的氧化和异构化过程。 DsbA蛋白负责氧化, DsbB是参与重新氧化DsbA的一个膜蛋白。还原形式的DsbC催化异构化过程。DsbC的还原态由DsbD维持。;肽基脯氨酰顺反异构酶 (PPI);对于大多数肽键而言,反式比顺式稳定1000倍。;结构:8个β折叠形成β折叠桶,外侧有两个α螺旋。 结合部位通过结合含脯氨酸的四肽(绿色)而定位。;PDI和PPI不仅可以起到折叠酶的催化作用,而且具有防止折叠中间体聚集的类似分子伴侣的功能。 王志珍等最早提出PDI是分子伴侣的假说并验证了PDI的这一功能 ;分子内伴侣(intramolecular chaperones);4.4、蛋白质的折叠病(fold disease);从本质上讲;疯牛病;PrP的一般性质 朊病毒蛋白(PrP)是由宿主基因编码的,其编码蛋白有两种形式,一种是正常的细胞型PrP(P

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