秦岭箭竹克隆多样性和克隆结构的SSR1教程.doc

秦岭箭竹遗传多样性和克隆结构的SSR分析 马青青 刘建军 （西北农林科技大学 林学院，陕西杨凌 712100）Fargesia qinlingensis）是佛坪国家级自然保护区内海拔1800-2600m林下的主要植被[1]。本文利用SSR分子标记技术对佛坪自然保护区秦岭箭竹的克隆多样性和克隆结构进行初步分析。结果表明：1）7对SSR引物对秦岭箭竹2个居群共142个样本进行扩增分析，共得到79个位点，其中多态性位点77个，多态位点百分率（PPB）为97.47%，Shannon多样性指数(I)为0.2263。2）AMOVA分析表明，较大的遗传变异来自居群内（70.49%），与基因分化系数（Gst=0.1418）的结果相同，两居群间有了中等程度遗传分化。3）与其他克隆植物相比，秦岭箭竹克隆多样性水平较高。基因型比率(PD)、Simpson指数和Fager均匀性指数（E）分别为0.7212、0.9127和0.5352，共得到107种基因型且没有共同的基因型，每个基株平均有1.5426个分株，最大基株跨度约为5m。4）克隆结构分析表明，秦岭箭竹的构型为密集型。 关键词：秦岭箭竹； 克隆多样性； 克隆结构； SSR 秦岭箭竹（Fargesia qinlingensis）属禾本科竹亚科箭竹属，仅分布于秦岭地区，耐寒性强，较耐干旱贫瘠土壤