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- 2017-05-10 发布于河南
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NCB介绍
NCBI及其它资源库的介绍 GenBank Overview 生物信息学站点地图 其它资源库的介绍 GenBank GenBank是一个有13亿碱基,来自于100,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。 ?遗传密码 - 15个遗传密码的概要。用来确保GenBank中纪录的编码序列被正确的翻译。 访问GenBank 通过Entrez Nucleotides来查询。 用accession number,作者姓名,物种,基因/蛋白名字,还有许多其他的文本术语来查询。 关于Entrez更多的信息请看下文。 用BLAST来在GenBank和其他数据库中进行序列相似搜索。 用E-mail来访问Entrez和BLAST可以通过Query和BLAST服务器。另外一种选择是可以用FTP下载整个的GenBank和更新数据。 纪录样本 每个记录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。 这些文件按类别分为几组:有些按照系统发生学划分,另外一些则按照生成DNA序列数据库的直接提交。这些作者将序列数据库作为论文的一部分来发表,或将数据库直接公开。 关于GenBank的各个字段的详细描述,以及同Entrez搜索字段的交叉索引。 ? DDBJ/EMBJ/GenBank特性表(见讲义或网络课件) 特性表格式和标准被合作数据
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