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2017-05-07 发布于湖北
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Genome paper organization Species introduction: Importance;Evolutionary status; Life cycle and development; Harmfulness. Pipeline for potato genome and comparative studies Summary for the castor bean genome Cocoa and Strawberry genome and comparing to others Statics for Cucumis sativus genome LEA familyFound in Date Palm Genome LEA family Exon P. dactylifera O.sativa A.thaliana Size MW(KDa) Top4 AA(%) Dehydrin 2.00 3 4 3 171 18.86 E(15.47)/G(14.78)/K(14.14.76)/H(9.37) LEA_1 2.00 3 4 3 155.33 16.66 A(17.55)/E(11.83)/K(11.38)/T(8.06) LEA_2 1.62 59 5 4 237.38 26.06 L(9.57)/V(9.03)/A(8.36)/S(8.35) LEA_3 2.00 5 6 18 96.6 10.12 A(19.26)/S(12.12)/R(10.32)/L(7.24) LEA_4 3.00 1 2 2 473.00 51.63 E(19.03)/A(15.86)/K(15.43)/G(8.46) LEA_5 1.00 2 0 0 87.50 9.46 G(16.54)/E(15.40)/R(10.82)/A(8.60) LEA_6 1.00 2 8 10 90.50 9.64 G(13.81)/E(8.86)/T(8.85)/P(8.30) SMP 2.75 4 5 6 256.75 26.69 A(17.36)/G(9.72)/V(9.54)/R(8.31) Total 　 79 34 51 　　　 LEA_2 LEA_5 Dehydrin LEA_4 LEA_1 LEA_6 LEA_3 SMP LEA family Gene expression of LEA Expansion of LEA family Overview of fruit transcriptomic data Tissue Total reads Mapped reads Unique mapped reads Expressed mRNAs 0DPP 76,515,395 53,825,507 11,396,571 17,464 15DPP 83,950,995 59,009,944 9,903,023 17,570 45DPP 77,132,786 53,999,668 12,355,849 15,920 75DPP 74,369,980 55,665,445 14,302,703 18,329 105DPP 71,372,371 52,916,490 12,403,501 16,349 120DPP 83,506,278 62,428,925 14,407,421 15,709 135DPP 98,713,383 70,080,905 10,247,674 15,978 Green leaf 94,042,176 45,735,383 14,697,605 16,022 Gene Expression Profile of Metablism Pathway During Date Palm Fruit Ripening Gene Expression Profile of Carbon Metablic Pathway During Date Palm Fruit Ripening Pan Linlin Pan Linlin Gene Expression Profile of Energy Metablic Pathway During Date Palm Fruit Ripening Enzymes Involved in Sugar Metabolism During Date Palm Fruit Development EC Pathway KO Enzyme name Days Post Pollination (RPKM normalized) green leaf Fruit/Leaf1 0 15 45 75 105 120 135