聚类分析及MATLAB实现研讨.pptVIP

聚类分析有两种：一种是对样品的分类，称为Q型，另一种是对变量（指标）的分类，称为R型。 ① 夹角余弦 两变量的夹角余弦定义为： ② 相关系数 两变量的相关系数定义为： 系统聚类法的基本思想 系统聚类分析的方法 最短距离 3.2.3 系统聚类法的步骤谱系聚类的步骤如下： 1. 选择样本间距离的定义及类间距离的定义； 2. 计算n个样本两两之间的距离，得到距离矩阵 3. 构造个类，每类只含有一个样本； 4. 合并符合类间距离定义要求的两类为一个新类； 5. 计算新类与当前各类的距离。若类的个数为1，则转到步骤6，否则回到步骤4; 6.画出聚类图； 7.决定类的个数和类。 系统聚类法的基本步骤 系统聚类分析用到的函数: Matlab实现聚类: Matlab提供了两种方法进行聚类分析。 一种是利用 clusterdata函数对样本数据进行一次聚类，其缺点为可供用户选择的面较窄，不能更改距离的计算方法； 另一种是分步聚类：（1）找到数据集合中变量两两之间的相似性和非相似性，用pdist函数计算变量之间的距离；（2）用 linkage函数定义变量之间的连接；（3）用 cophenetic函数评价聚类信息；（4）用cluster函数创建聚类。 说明：用 ‘metric’指定的方法计算 X 数据矩阵中对象之间的距离。’ X：一个n×m的矩阵，它是由n个对象组成