第二章 蛋白质的结构与功能精编.ppt

蛋白质结构的主要层次 Section1 蛋白质的一级结构Primary Structure 胰岛素： 1954年，Sanger最早确定胰岛素一级结构 1965年，我国科学家人工合成结晶牛胰岛素 一级结构是蛋白质最基本的结构，它内含着决定蛋白质高级结构和生物功能的信息。 Section2 蛋白质的二级结构 a.肽键的部分双键性质 b.非键合原子之间的最小接触距离 是多肽链折叠的空间限制因素。 肽键(-CONH- ) 中的４个原子和２个α碳原子( Cα)构成一个刚性平面，即肽平面，或肽单元或肽基。 肽平面与α-碳原子的二面角（ φ和ψ ） 完全伸展的肽主链构象 然而 ?和 ? 同时等于0°时的构象实际上并不能存在，因为两个相邻平面上的酰胺基H原子和羰基Ｏ原子的接触距离比其范德华半径之和小，因此将发生空间重叠(steric overlap)。这样的构象是立体化学所不允许的。 二面角(?，? )所决定的构象是否存在，主要取决于两个相邻肽单位中，非键合原子之间的接近有无阻碍。 ★典型?-螺旋 ?=-57°, ?=-47° 多肽链中的各个肽平面围绕同一轴旋转，形成螺旋结构，螺旋一周，沿轴上升的距离即螺距为0.54nm,含3.6个AA残基；每个AA残基沿轴转100?，上升0.15nm; 肽链内形成氢键，氢键的取向几乎与轴平行， 第1个肽键的-CO氧与它后面第4个AA残基上的-N-H氢形成氢键。 ?-螺旋的稳定性就靠这种氢键来维持。 蛋白质分子为右手?-螺旋。 另外，如果肽链中连续存在带相同电荷的氨基酸残基(如Lys、Arg或Asp、Glu)，由于同性电荷相斥也会影响?-螺旋的形成。 ★2)?-折叠（ ?-pleated sheet） ?-折叠特征 ?-折叠结构的氢键主要是由相邻肽链主链 上的-NH和C=O之间形成的，如纤维状蛋白质中的?-折叠；也可以在同一肽链上的不同部分之间形成，如在球状蛋白质中。 氢键与肽链的长轴接近垂直。 多肽链主链呈锯齿状折叠构象 侧链R基团交替地分布在片层平面的两侧。 ?-折叠的两种类型 ?-折叠有两种类型:平行式(parallel)和反平行式(anti-parallel） 平行式(parallel)，即所有肽链的N-端都在同一边。 实例： 纤维状蛋白质含大量的α-螺旋，β-折叠片。 角蛋白广泛存在于动物的皮肤及其衍生物，如毛发、甲、角、鳞和羽等，属于结构蛋白。 ?-角蛋白是?-螺旋的典型实例，主要由?-螺旋构象的多肽链组成。 ?-角蛋白 例如毛发的纤维是由多个原纤维平行排列，并由氢键和二硫键作为交联键聚集成不溶性的蛋白质。 ?-角蛋白的伸缩性能很好，当?-角蛋白被过度拉伸时，则氢键被破坏而不能复原。此时?-角蛋白转变成?-折叠结构，称为?-角蛋白。 角蛋白分子中的二硫键 卷发(烫发)的生物化学基础 烫发：?-角蛋白在湿热条件下可以伸展转变为?-折叠构象，但在冷却干燥时又可自发地恢复原状。 这是因为?-角蛋白的侧链R基一般都比较大，不适于处在?-构象状态，此外?-角蛋白中的螺旋多肽链间有着很多的二硫键交联，这些交联键也是当外力解除后使肽链恢复原状(?-螺旋构象)的重要力量。 卷发的生化过程 首先，把头发卷成一定的形状，然后涂上还原剂(一般是含巯基的化合物)溶液并加热。还原剂可以打开链间的二硫键。湿热破坏氢健使头发?-角蛋白的螺旋结构展开并伸直。 然后，除去还原剂，涂上氧化剂以便在相邻多肽链的半胱氨酸残基对（但不是处理前原来存在的残基对）之间建立新的二硫键。 当洗涤并冷却头发时，多肽链回到原来的?-螺旋构象。这时头发将以所希望的形式卷曲，因为新的二硫交联键的形成使得头发纤维的?- 螺旋束发生扭曲。 Section3 蛋白质的三级结构 （tertary structure） 蛋白质的三级结构是指在二级结构基础上，肽链的不同区段（?-螺旋、?-折叠、?-转角等）的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构。 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 构型和构象（P42） 构型（configuration）是指在立体异构中，不对称碳原子上相连的各原子或取代基团固定的空间排列。（D-构型、L-构型）。 构型的改变伴随着共价键的断裂和重新形成。 一、稳定蛋白质高级结构的作用力 维系蛋白质一级结构的作用力： 共价键：肽键和二硫键 维系蛋白质高级结构的作用力： 非共价键（次级键）：氢键(二级结构）、疏水键（三级结构）、离子键和范德华力等， 1. 氢键： 氢键(hydrogen bond)的形成常见于连接