肿瘤与基因研讨.ppt

ASCO/CAP2013指南关于乳腺癌HER2检测推荐： IHC检测HER2蛋白表达水平 FISH检测HER2基因扩增 FDA 2013年关于胃癌HER2检测流程建议 ALK 最早是在间变性大细胞淋巴瘤（ALCL 的一个亚型中被发现的，因此定名为间变性淋巴瘤激酶（anaplasticlymphoma kinase，ALK）。随后，在发现非小细胞肺癌中有ALK基因重排之前，在弥漫性大B细胞淋巴瘤和炎症性肌纤维母细胞瘤（IMT）中分别发现了有多种类型的ALK基因重排，至此证明ALK是强力致癌驱动基因。 变异类型：重排 检测方法：ALK分离荧光原位杂交检测，是ALK诊断检测最终获得FDA批准，用于检测ALK基因重排非小细胞肺癌，连同克唑替尼?获得美国批准的基础，也是目前唯一经临床验证的ALK检测方法。 EML4-ALK融合基因——克唑替尼的靶标 已发现并确认至少9种EML4-ALK融合基因的突变体：v1、v2、v3a、v3b、v4、v5a、v5b、 v6、v7。 检测方法：RT-PCR, FISH, PCR、测序等 RB RB基因 Retinoblastoma gene 即成视网膜细胞瘤基因，为视网膜母细胞瘤易感基因，是世界上第一个被克隆和完成全序列测定的抑癌基因。 突变类型：缺失，突变。 检测技术：PCR，PCR-SSCP Page ? * 肿瘤与基因 2015-12-15 人类基因组计划 人类基因组计划（HGP）于1990年正式启动了2003年完成了所有研究目标。已完成的基因序列图覆盖了人类基因组99%的区域，精确率达到了99.99%。那是一部长达100万页，每页3，000个字符的巨著！ 诺贝尔获得者杜伯克曾说:人类的DNA序列是人类的真谛，这个世界上发生的一切事情，都与这序列息息相关。 一个人的基因组信息要用3GB的光盘存储。 一个人每分钟敲击60字，每天工作8小时，50年才能 全部记录一个人的DNA信息。 每个人体内都有数万亿细胞，每个细胞的细胞核内 都有46个（23对）染色体。 每个独立染色体就叫DNA。 如果展开，仅一个细胞内的DNA就能有1.83米，如果 把一个人的DNA全展开，长度相当于从地球到太阳610 次。 环境因素 物理因素 化学因素 生物因素 体内微环境 人类基因组 肿瘤是一种环境因素与遗传因素相互作用导致的疾病, 大多数的环境致病因素的致癌作用都是通过影响遗传基因起作用的。 基因变异的类型 癌基因：点突变（K-Ras、H-Ras）、插入突变（Int-2）、扩增（myc, erbB 、Ras）、重排（Trk、Ret）染色体易位（Bcr/Abl、Bcl-2）、低甲基化（ER、PR）。 抑癌基因：突变（P53、P16）、丢失（Rb、P53）、失活（DCC）、 高甲基化。 促进肿瘤转移的基因（MTA1、C-KIT、EF1A） 抑制肿瘤转移基因 nm23-H1 、BRMS1、H2-K、KISS1 肿瘤的发生源于遗传物质DNA的改变 这种改变是多步骤完成的多个基因变化的细胞进化过程 不仅癌基因之间有协同作用，癌基因与抑癌基因之间也存在协同作用 基因检测 基因检测的分类 诊断性基因检测 多数用于有症状单基因疾病诊断 单基因疾病症状出现前的诊断 预测性基因检测 数用于多基因常见疾病的遗传风险预测 个体化用药基因检测 多用于指导临床药物治疗 基因检测与肿瘤？ 风险预测 我是否易得某种肿瘤？ 复发监控 疗效判断 治疗选择 预后判断 临床分期 鉴别诊断 早期筛查 我的肿瘤会如何进展？ 我现在是否可能有肿瘤？ 我的肿瘤是什么类型的？ 我的肿瘤扩散了吗？ 我的肿瘤回来了吗？ 我的治疗起作用了吗？ 最适合我的治疗是什么？ 如： CtDNA CTC PSA CEA AFP … … 如： EML4-ALK HER2 MSI … … 如： CTC Ct-DNA … … 如： EGFR ERCC1 HER2 … … 如： 21基因 CTC 放疗敏感 PAM50 MSI 放疗毒副 … … 如： CTC Ct-DNA … … 如： CTC Ct-DNA … … 如： BRCA1/2 CDH1 APC MMR RET … … 基因检测方法介绍 基因变异的检测方法 显微切割+直接测序 测序法 荧光定量PCR法 ARMS 方法 Mutation-riched PCR PCR-SSCP 甲基化的检测（Northern印迹，Western印迹，HRM） FISH CtDNA 显微切割+直接测序 原理：利用紫外激光对生物样本进行 切割和分离，通过弹射装置将 目的细胞收集于EP 管内。 功能：通过从诊断明确的组织中切取 获得的细胞或细胞成份，提取 核酸，可用于PCR 、DHPLC 等。 切割之前的目的癌巢