分子流行病学-南京医科大学公共卫生学院流行病学课件.ppt

分子流行病学; 第一节 概述 第二节 分子流行病学的研究内容 第三节 分子流行病学的研究方法;分子流行病学产生的背景;;分子流行病学的发展历程;;Numbers of Papers with Subject Words “Molecular Epidemiology” on Medline;分子流行病学定义;; 特点;传统流行病学和分子流行病学;;;分子流行病学现况; 研究内容;生物标志的概念 广义的生物标志物(biological markers , biomarkers) 是指生物材料中与有害因素接触有关的机体的各种变化, 包括生理、生化、免疫、细胞和遗传等方面的改变。 分子生物标志物(molecular biomarkers) 直接反映外来理化因素与细胞靶分子, 特别是生物大分子如核酸和蛋白质的相互作用及其后果, 因而具有较高的敏感性。 ;生物标志物的种类;;;;;;;MUTAGEN SENSITIVITY ASSAY;;;;Genetic Diversity;;;生物标志的选定;暴露测量;暴露标志的局限性;效应测量;易感性测量;分子流行病学的应用;;;4、传染病流行规律的研究 （1）传播范围的确定 （2）传播途径的判定 分子进化诊断（molecular evolutionary diagnosis），判断HCV在配偶之间的传播。（HCV-RNA的基因型别，毒株的分株时间（divergence time） （3）传染源的追索 美国1990~1991年报道佛罗里达一个口腔诊所有1名患有艾滋病的牙医，被他看过病的患者中有7名后来感染了HIV，然而经过分子流行病学研究发现，其中5名患者的HIV与牙医的HIV有共同的氨基酸特异模式（signature pattern），而且序列的差异率5.0%，为同一病毒株；而另2名患者的HIV则与牙医的不同。因此，通过序列分析，从分子水平确定了前5名病人的HIV感染是由牙医引起，而后2名病人的传染来源则不是牙医。 ;; 研究方法;; 标本采集的一般要求 在采集和储存过程中不能受到“污染” 储存的生物标本在任何时候进行检测都可以获得一致的结果 所有的生物标本都应有详细的背景材料和鉴别标识。 常用的生物标本有: 微生物标本、血液标本、组织标本以及其他一些体液、头发、媒介生物等. ;;常用的实验室检测技术;;Blood Sample Processing and Biomarker Assay Flow Chart; 现场分子流行病学研究方法;;XRCC1多态性位点的各基因型在病例组和对照组中的分布;;研究设计与资料分析;;（五）资料的整理与分析 1.资料的整理 2.数据的分析 描述性研究 描述研究对象的一般特征 均衡性检验 统计性推断分析 暴露与疾病的统计学关联强度，并确定关联强度的大小 ;;实验室中的质量控制; 常见偏倚及其控制;研究实例;;; 1、研究对象的一般特征 ;;分子流行病学目前面临的问题;;;