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2模板制备资料
(2)PCR模板的制备 -核酸提取及纯化;PCR模板制备;PCR模板制备与纯化;PCR模板的使用;2 PCR的模板纯化-核酸提取; 基因组DNA的提取;植物基因组DNA-CTAB法; CTAB提取缓冲液的经典配方; CTAB提取缓冲液的改进配方; CTAB法流程图;; SDS法原理; SDS法DNA提取缓冲液; SDS法流程图 (以动物组织为例) ;基因组DNA-其它方法; 浓盐法:
有机溶剂抽提法:
密度梯度离心法:
; 非基因组DNA的提取;质粒DNA-碱裂解法; 碱裂解法流程图;质粒DNA-煮沸法;细胞器DNA-差速离心法;DNA提取的基本步骤;材料准备;细胞裂解;核酸分离、纯化;蛋白质的去除:
酚/氯仿抽提
使用变性剂变性(SDS、异硫氰酸胍等)
高盐洗涤
蛋白酶处理
;多糖的去除:
高盐法:用乙醇沉淀时,在待沉淀溶液中加入1/2体积的5M NaCl,高盐可溶解多糖。
用多糖水解酶将多糖降解。
在提取缓冲液中加一定量的氯苯(1/2体积),氯苯可以与多糖的羟基作用,从而去除多糖 。
用PEG8000代替乙醇沉淀DNA:在500μL DNA液中加入200μl 20% PEG8000 (含1.2 M NaCl) ,冰浴20min。;多酚的去除:
在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂:β-巯基乙醇、抗坏血酸、半胱氨酸、二硫苏糖醇等
加入易与酚类结合的试剂:如PVP、PEG(聚乙二醇),它们与酚类有较强的亲和力,可防止酚类与DNA的结合;基因组DNA的检测;RNA提取的通用方法; 步骤:
材料准备:尽量新鲜。
裂解变性:异硫氰酸胍(亚硫氢胍,巯基乙醇,N-月桂肌氨酸等)。
使细胞及核蛋白复合物变性,释放RNA,有效抑制核酸酶。
纯化分离:苯酚,氯仿,异戊醇。苯酚/氯仿可抽提去除杂物。
洗涤:70%乙醇。
沉淀:异丙醇、无水乙醇。
乙酸钠(pH4.0):维持变性的细胞裂解液的pH值,沉淀RNA。
此外还常用氯化锂选择沉淀RNA。;RNA操作中的要求 抑制RNase活性是提取RNA的关键
在实验中,严格控制内源性和外源性RNase的污染。RNase可耐受多种处理而不被灭活,如煮沸、高压灭菌等。外源性RNase存在于操作人员的手汗、唾液等,也可存在于灰尘中。在其它分子生物学实验中使用的RNase也会造成污染。这些外源性的RNase可污染器械、玻璃制品、塑料制品、电泳 槽、研究人员的手及各种试剂。而各种组织和细胞中则含有大量内源性的RNase 。 ; 一、 防止RNA酶污染的措施
1. ? 所有的玻璃器皿均应在使用前于180℃的高温下干烤6hr或更长时间
2. ? 塑料器皿可用0.1% DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)
3. ? 有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3% H2O2 室温10min,然后用0.1% DEPC水冲洗,晾干。
4. ? 配制的溶液应尽可能的用0.1% DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经0.22μm滤膜过滤除菌
5. ? 操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换。
6. ? 设置RNA操作专用实验室,所有器械等应为专用。;二、常用的RNA酶抑制剂
焦磷酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。高温条件下分解。
异硫氰酸胍:目前被认为是最有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离???来,又对RNA酶有强烈的变性作用。
氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。
RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。
其它:SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用。 ;RNA的分离和纯化- TRIzol试剂法;RNA的鉴定;影响RNA提取的因素;; 样品破碎及裂解:
根据不同材料选择不同的处理方法:
培养细胞:通常可直接加裂解液裂解
酵母和细菌:一般TRIzol可直接裂解,对于一些特殊的材料可先用酶或者机械方法破壁
动植物组织:先液氮研磨和匀浆,后加裂解液裂解。期间动作快速,样品保持冷冻
样品量适当,保证充分裂解
为减少DNA污染,可
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