3、真核基因表达调控资料.pptVIP

第三节 真核基因表达调控 ;真核细胞基因组全能性的实验证据 ; 真核细胞基因组的复杂性： e.g., human genome: 约30亿 bp DNA；包含约3万个基因；95％的非编码DNA序列（功能？）； 一生合成总蛋白质的种类约10万种，但在一个典型的分化细胞中合成约5000种蛋白质；如何调控？ 人类基因组计划（HGP） 功能基因组学：基因及其产物（蛋白质）的功能。;根据其性质可分为两大类：;从DNA到蛋白质的可能的调控步骤 ; 主要调控水平： *－转录水平调控（transcriptional control） *－转录后水平调控（post-transcriptional control） RNA加工水平调控（RNA processing control） 翻译水平调控（translational control） －蛋白质的翻译后修饰（post-translational modification）; 一、转录水平的调控 基本概念： 事件：DNA/protein, protein/protein 相互作用； 顺式作用元件（cis-acting element）：与转录调控蛋白特异 结合的DNA序列； 反式作用因子（trans-acting factor）：与特定DNA序列结 合的调控蛋白因子； “模体”结构（motif）：蛋白质中的小结构域，由一小段保 守的氨基酸构成，用以识别特定的DNA序列或其他蛋白质； e.g., helix-turn-helix, zinc-finger, ?-sheet, leucin-zip, etc.; 共有序列（consensus sequence）：DNA中一小段保守序列（有时也指蛋白质中的氨基酸序列），能够被特定的蛋白结构域所识别，在转录起始调控中起重要作用；e.g., TATA-box, CAAT-box, GC-box, etc. 通用转录因子（general transcription factor）：与核心启动子元件相结合（如TATA-box），启动转录； 特异转录因子（specific transcription factor ）：与基因的特异调控元件相结合，起调节作用（促进或阻抑）；;（一）、转录的激活（transcriptional activation） 1，转录的起始 涉及一系列的DNA/protein, protein/protein 相互作用；转录起始复合体（pre-initiation complex）的形成，etc.; 真核基因的结构;转录的起始;2，激活因子（activator）和辅激活因子（co-activator） 特异性的转录因子，能在DNA序列上形成复合体，激活转录；e.g., 肾上腺（糖）皮质激素的作用：glucocorticoid/GRE;转录因子（通用转录因子和特异转录因子）的功能结构域： - DNA结合结构域（DNA-binding domain）：与基因的 调控区域的特定DNA序列识别并结合 - 激活结构域（activation domain）：招募其他激活因子 和蛋白质，共同启动或激活转录;真核基因转录的调控（gene control regions）;3，基因远端的调控元件 — 增强子（enhancer） 特点： 距离基因的起始点较远 位置不定：上游、下游、内含子内部 方向性：正反方向均有作用 作用机制： 间隔DNA可以形成环状 通过与enhancer结合的特异因子起作用 染色质构型的改变（重塑）;基因远端的增强子促进转录复合体的装配;（二）、转录的阻抑（transcriptional repression） 1，顺式作用元件／反式作用因子 阻抑物（repressor）：负调控的特异性转录因子 沉默子（silencer）：负调控的DNA元件 作用机制： 阻抑转录起始复合体的组装（与通用转录因子作用） 与转录激活因子竞争结合DNA 与转录激活因子相互作用，影响其活性 改变染色质构型（招募重塑复合体、组蛋白修饰酶）;阻抑因子（repressor）抑制基因转录的可能机制;2，DNA甲基化（DNA methylation） CG岛（CG island）：基因组DNA中富含GC碱基的区域， 其中一些对称序列中的 5’-CG-3’ 二核苷酸的胞嘧啶（C） 常被甲基化修饰；与基因的失活有关。 DNA甲基转移