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第八部分非编码RNA与基因表达及其调控;RNA可在不同层次调控蛋白质编码基因的表达。;非编码RNA;管家ncRNA(house-keeping non-coding RNA):
是指RNA直接或间接参与蛋白质编码基因的表达,是蛋白质合成是必需的因素。
调节性ncRNA(regulatory non-coding RNA):
是指大部分非编码RNA,在一定条件下诱导表达,其功能是调节蛋白质编码基因的表达。;管家ncRNA:tRNA, rRNA, snRNA, snoRNA, SL RNA及SRP RNA
调节性ncRNA:长链非编码RNA ,短链非编码RNA
长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)
分子﹥200nt。
短链非编码RNA(﹤50nt):miRNA, siRNA, ;第一节非编码RNA与蛋白质编码基因表达的关系;一、组成性表达的非编码 RNA 直接或间接 参与蛋白质编码基因的表达;参与蛋白质合成的非编码RNA;参与RNA加工的非编码RNA;二、调节性非编码 RNA调控蛋白质编码基因的表达;长链非编码 RNA;lncRNA的特点;微RNA ; 2001年10月《science》报道了三个实验室从线虫、果蝇和人体克隆的几十个类似C.elegan的lin-4的小RNA基因,称为microRNA。
随后多个研究小组在包括人类、果蝇、植物等多种生物物种中鉴别出数百个miRNAs。
miRNAs参与生命过程中一系列的重要进程,包括发育进程、造血过程、器官形成、凋亡、细胞增殖、甚至是肿瘤发生。;miRNA的命名与miRNA家族;miRNA与靶mRNA的结合具有相对特异性;miR-21与几种靶mRNA的互补结合;干扰小RNA;siRNA主要与AGO2结合形成复合体,称RNA诱导的沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC),通过降解靶mRNA而导致基因表达的沉默。
与miRNA 不同, siRNA与靶mRNA完全互补,在抑制基因表达时具有更高的特异性。;参与蛋白质编码基因表达的非编码RNA都是组成性表达,其表达量在细胞内相对较稳定。
调节性非编码RNA是依据基因表达调控的需要、根据内外环境的变化而产生。;第二节调节性非编码RNA的表达;一、eRNA和pncRNA从相应的DNA序列转录;二、长链非编码RNA可从不同的DNA序列转录;长链非编码RNA的表达也受到调控;2. lncRNA的稳定性受到不同因素影响
一些lncRNA的3′末端可形成三螺旋结构,保护lncRNA末端免受3′→5′外切核酸酶破坏,使转录产物更稳定。
有些lncRNA稳定性与特定RNA结合蛋白有关,并受miRNA的调控。; 大部分lncRNA降解机制目前仍不清楚。但也存在一些规律。
蛋白质编码基因间DNA序列转录产生lncRNA和反义lncRNA比蛋白质编码基因内转录的lncRNA稳定。
经过剪接加工的lncRNA比未剪接的lncRNA稳定。
胞质比核内lncRNA稳定。
;三、真核生物miRNA主要来源;四、内源性siRNA是从不同的双链RNA加工产生;第三节非编码RNA调控mRNA合成; 转录水平调控是基因表达调节重要的环节。涉及染色质区域结构重塑、组蛋白和DNA修饰、转录因子和RNA聚合酶功能的增强或抑制等。
这些调控作用除了许多蛋白质参与,也有非编码RNA参与。调控机制主要涉及非编码RNA与DNA及蛋白质的相互作用。
;一、非编码RNA参与调控染色质结构;(一)lncRNA促进形成致密染色质结构
(二)lncRNA通过募集染色质重塑复合体调
控组蛋白修饰
(三)miRNA可间接影响组蛋白修饰
(四)非编码RNA调控DNA甲基
;二、非编码RNA调控转录因子的作用;三、非编码RNA影响RNA聚合酶Ⅱ的转录功能;四、 lncRNA影响mRNA转录后加工和运输;第四节非编码RNA调控蛋白质合成;一、 miRISC结合靶mRNA而抑制翻译;二、 lncRNA干扰mRNA的翻译;三、 非编码RNA促进mRNA降解而抑制翻译;四、 lncRNA结合mRNA而促进翻译;五、 miRNA前体可竞争结合阻遏蛋白而促进翻译起始;六、 lncRNA吸收miRNA而促进翻译;siRNA与miRNA相同点;不同点
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