小论文-CASTEP模块计算表面上的吸附能.pptVIP

小论文;注意，不能用中文建目录。 计算结果要及时保存。;CO吸附在Pd（110）面 ;本课程包括： 1. 准备项目 2．最优化Pd 3. 构造和优化CO 4．构造Pd(110) 面 5. Relaxing Pd(110)面 6. 添加CO到1x1Pd(110)，优化此结构 7. 设置和优化2x1Pd(110)面 8. 分析能量 9. 分析态密度;;1．准备项目 选一路径，建立一个CO-Pd文件夹。然后按下列操作， 在CO-Pd文件夹中生成CO-Pd的Project。;;2．最优化bulk Pd ; ; 把Task从Energy改为Geometry Optimization，按下More...按钮，在 CASTEP Geometry Optimization对话框中选中Optimize Cell选项。按下Run键。出现一个关于转换为原胞的信息框，按下OK。 ;工作递交后，开始运行。结束后出现如下信息。; 工作完成后，我们保存项目，选择File | Save Project。然后在Project Explorer中打开位于Pd CASTEP GeomOpt文件夹中的Pd.xsd，显示的即为Pd优化后的原胞结构。由下面步骤恢复Pd优化后的晶胞结构。;在左侧的Properties中选择Lattice 3D，从中可以看到优化后的晶格参数大约为3.95 ?，其而其实验值为3.89 ?。 ;现在我们应该进行下一步操作，构造CO分子。; ; CO分子中C-O键的键长实验值是1.1283 ?。通过笛卡儿坐标系来添加原子，我们可以精确的创建此种键长的CO分子。 ; 这样就将CO分子周期性地放到晶格中。测量一下CO键长。;从工具栏中选择CASTEP 工具，然后选择Calculation。 ;;出现如下对话框，选择No。;出现如下信息，表示CO优化成功。;从菜单栏中选择File | Save Project，然后在选中Window | Close All。我们可以进行下一步操作。 4．构造Pd(110)面 下面我们将要用到从Pd bulk中获得的Pd优化结构。 在Pd bulk/Pd CASTEPGeomOpt文档中打开Pd.xsd。;创建表面分为两个步骤。第一步是劈开表面，第二步是创建一个包含表面的真空板。 从菜单栏中选择Build | Surfaces | Cleave Surface。;把the Cleave plane (h k l)从（-1 0 0）改为（1 1 0），然后按下TAB键。把Fractional Thickness增加到1.5，按下Cleave按钮，关闭对话框。注意，表面平行于z轴，后面要改。;此时，显示出一个包含有二维周期性表面的全新的三维模型文档。 由下列操作可显示更大的表面范围。; 尽管如此，CASTEP要求有一个三维周期性的输入体系。我们可以用Vacuum Slab工具来获得。 在菜单栏中选择Build | Crystals | Vacuum Slab;则结构由二维变成三维，把真空添加到了原子上。;这时表面平行于z轴，在xy的角平分线上。;;; ; 在3D Viewer上单击右键，选择Display Style选项，选择Line，则从结构图上可清楚看到O－ABC。记住相对方位，恢复显示位Ball and Stick。;; 把Z坐标最大值所对应的Pd原子称为最高层Pd原子。 在本指南的稍后部分，我们要求知道原子层间的距离do，我们可以通过计算原子坐标来得到。 ;1; 在3D model document中单击右键，选择Display Style。然后选中Lattice标签，在Display中，把Style从Default改为Origina。 ; 从菜单栏中选择View | Explorers | Properties Explorer，选择FractionalXYZ中X=0.5，Y=0.5 的Pd原子。注意从XYZ属性中所获得的Z的坐标值。 ;选中; 在3D模型文档中单击以取消所选中的原子。单击右键选择Display Style，在Atoms标签的Coloring部分，把Color by选项改为Constraint。3D模型文档显示如下： ; 这个结构用来做Pd(110)表面的弛豫，它同时也是优化CO 分子在Pd(110)表面的起始模型。; Pd(110).xsd为当前文件。从菜单栏中选择 File