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第三章 蛋白质研究技术;第一节 蛋白质的分离与纯化; 蛋白质分离纯化;一、蛋白质分离纯化的基本原则;二、蛋白质分离纯化的方法;1.离心(centrifugation);离心(centrifugation);①.差速离心(differential centrifugation) 利用不同物质沉降速率的差异,通过离心速度差异分离不同质量颗粒的离心技术。 ;细胞成份的差速离心分离;②.速率区带离心(rate-zonal centrifugation) 也称平衡密度梯度离心,根据颗粒在介质中的沉降速度差异分离目标颗粒的方法。; ;2. 电泳(electrophoresis) ;①SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-polyacrylamide
gel electrophoresis,SDS)
②等电聚焦(isoelectric focusing ,IEF )
③双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis)
④脉冲电泳(pulsed-field gel electrophoresis)
;①.SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-polyacrylamide gel electrophoresis,PAGE);SDS ;SDS ;②.等电聚焦(isoelectric focusing,IEF);电泳过程中不连续电泳的三种效应:
浓缩效应,
分子筛效应
电荷效应
;③.双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis);双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis);双向电泳(two-dimensional gel electrophoresis);④.脉冲电泳(pulsed-field gel electrophoresis);3.层析(chromatography);凝胶类型及型号与蛋白质分子量;层析(chromatography); ①. 凝胶过滤层析(gel filtration chromatography ) ;凝胶过滤层析; 基本原理
凝胶上柱后,颗粒外的外水体积(Vo),颗粒内体积称内水体积(Vi),颗粒中胶的体积(Vg),因而,总的柱床体积(Vt),Vt=Vo+Vi+Vg,Vg可忽略。Vt=Vo+Vi 。;①当kd=0时,Ve=Vo,溶质全从Vo
出来,无分配。
②当kd=1时,Ve=Vo+Vi,溶质全进
筛子,各物质尽管有分配,但
各物质不能分开。
③当0kd1时, Ve=Vo+kd·Vi各溶
质具不同分配,以得到分离。;②.离子交换层析(ion-exchange chromatography,IEC);离子交换层析(ion-exchange chromatography);③.亲和层析(affinity chromatography);;亲和层析;金属螯合层析法(MCAE);4.膜蛋白的分离方法;几种去污剂;?低浓度时,去污剂以游离形式存在于溶液中。随着浓度的增加,它们聚合在一起,形成微团(micelles).
?微团很小、圆球状聚集物。其亲水部分向外,疏水部分向内。
临界微团浓度(critical micelle concentration,CMC):去污剂开始形成微团时的浓度,为去污剂的特征常数;?离子型去污剂:除了能与膜蛋白的疏水区结合外,还能结合水溶性蛋白质的疏水核心。由于它们带电,所以能够破坏蛋白质中的盐键和氢键, 使蛋白质变性。
?非离子型去污剂:比离子型温和,不同浓度有不同作用方式
?高浓度(CMC)时,与磷脂、膜蛋白一起形成微团.
?低浓度(CMC)时,虽然不形成微团,但仍能与大部
分膜蛋白的疏水区结合,起增溶作用.;?大部分膜周边蛋白(peripheral protein)是可溶性。它们借离子键或其他弱键与特定的膜蛋白结合,因此可用高浓度的盐或能与二价阳离子(如 Ca2+)结合的试剂进行分离。
?开发既保持膜蛋白的天然结构,又高产和高纯度纯化方法是人们的期待。(Novagen新开发TM-PEK: ProteoExtract膜蛋白抽提试剂盒);第二节 蛋白质的鉴定;一、分子量测定;1.渗透压(osmotic pressure);2. 沉降平衡(sedimentation equilibrium);3.凝胶过滤层析(gel fitration chromatography);4. SDS;SDS用以分析蛋白质的分子量;5. 激光解吸电离飞行时间质谱(laser desorption ionization-time of flight-mas
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