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DNA Structure and genome organization;DNA : basic unit of inheritance for all living organisms
控制了生物的性状(部分virus以RNA作为hereditary substance ); Discover the double-helix structure of DNA---by James Watson and Francis Crick;DNA : Large, chainlike molecule of phosphric acid, sugar and purine and pyrimidine bases
;组成DNA分子的碱基只有4种,即;构成核苷酸分子的碱基结构
;一、 DNA的结构;;核苷酸的结构;The primary structure;3’;Structure of DNA-Overview;核苷酸序列对DNA高级结构的形成有很大影响。
例如: B-DNA中多聚(G-C)区易出现左手螺旋
DNA(Z-DNA);
反向重复的DNA片段易出现发卡式结构等 。 ; DNA结构的表示法;;3、两条链上的碱基通过氢键相结合,形成碱基对,它的组成有一定的规律。
这就是嘌呤与嘧啶配对,而且腺嘌呤(A)只能与胸腺嘧啶(T)配对,鸟嘌呤(G)只能与胞嘧啶(C)配对。???一条链上某一碱基是C,另一条链上与它配对的碱基必定是G。碱基之间的这种一一对应的关系叫碱基互补配对原则。
组成DNA分子的碱基虽然只有4种,它们的配对方式也只有A与T,C与G两种,但是,由于碱基可以任何顺序排列,构成了DNA分子的多样性。
例如,某DNA分子的一条多核苷酸链有100个不同的碱基组成,它们的可能排列方式就是4100 。
;;多聚核苷酸链中新生磷酸糖苷键的产生过程示意图;2、 The secondary structure :
two anti-parallel chains(反向平行双链)
base pairing(碱基配对):
complementary(互补); hydrogen bonds
right-handed double-helix(右手双螺旋)
在生物活体内,DNA的二级结构和高级结构,都是时刻变化的,即在二级结构的各种构象间、在二级结构与高级结构间或高级结构的各种构象间存在一个动力学的平衡。
DNA的二级结构分两大类:一类是右手螺旋(A-DNA和B-DNA);另一类是左手螺旋(Z-DNA);;1. DNA右手螺旋的几种构象及其动态平衡
?由两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴构成的右手螺旋结构;
?多核苷酸的方向由核苷酸间的磷酸二酯键的走向决定,一条5’→3’,另一条从3’→5 ’;
?由于碱基对的方向性,使得碱基对占据的空间是不对称的,因此在双螺旋的表面形成二个螺旋型的凹下去的槽,其中一条较浅,叫小沟,一条较深,叫大沟;
?两条链上的碱基以氢键相连,G与C配对,A与T配对,嘌呤和嘧啶碱基对层叠于双螺旋的内侧,核苷酸的磷酸基团与脱氧核糖在外侧,通过磷酸二酯键相连接而构成DNA分子的骨架。;碱基平面与纵轴垂直,且螺旋的轴心穿过氢键的中点,相邻碱基对平面之间的距离为0.34nm,以3.6nm为一个结构重复周期,脱氧核苷酸环平面与纵轴大致平行,双螺旋的直径为2.0nm。;;DNA Structure — Linkages;Computer Generated Model of DNA;A-T丰富的DNA片段常呈B-DNA,若DNA双链中一条链被相应的RNA链所替换,会变成A-DNA。
当DNA处于转录状态时,DNA模板链与由它所转录所得的RNA链形成的双链就是A-DNA,说明A-DNA构象对基因表达有重要意义。
B-DNA双链都被RNA链所取代而得到由两条RNA链组成的双螺旋结构也是A-DNA。
另外还存在B’-DNA、C-DNA和D-DNA等右手螺旋DNA。;1、某双链DNA分子的碱基中,鸟嘌呤占30%,则胸腺嘧啶为_____;2. DNA二级结构中左手螺旋——Z-DNA
荷兰科学家Rich等在1979年首次发现左手螺旋的Z-DNA。
Z-DNA调控基因转录的两个模式:
?在邻近调控系统中,与调节区相邻的转录区被Z-DNA抑制,只有当Z-DNA转变为B-DNA后,转录才得以活化。
? 在远距离调控系统中,Z-DNA可通过改变负超螺旋水平,决定聚合酶能否与模板链相结合而调节转录起始活性。;指DNA双螺旋进一步扭曲盘绕所形成的特定空间结构。超螺旋结构是DNA高级结构的主要形式,可分为
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