07第七讲 蛋白质结构预测.pptVIP

第七讲 蛋白质结构预测 内 容 概述 蛋白质的序列分析 蛋白质二级结构预测 蛋白质三维结构的预测 主要生物信息学资源（蛋白质数据库） 生物信息学方法的应用（简单介绍） 预测蛋白性质和结构 一、概述 蛋白质结构研究的重要性 基因序列→蛋白质序列→蛋白质空间构象→生物功能 解析蛋白质的空间结构——有利于认识蛋白质的功能？认识蛋白质是如何执行功能的？认识结构与功能的关系？ 基础——设计和创造新蛋白 现代结构测定技术虽然发展迅速，但是非常复杂，费用很高。 特别是已知结构的蛋白质，反复测定，费用高昂 基因组序列分析→导出大量的蛋白序列→但蛋白的空间结构未知 ？ 结构测定面临的巨大挑战——蛋白质种类数量庞大，依靠结构测定方法获得空间结构信息面临巨大挑战 ？ 假如研究中对cDNA翻译的序列高级结构一无所知， ——首先通过结构预测，提供实验设计思路 ？ 3. 蛋白质结构预测的可行性分析 Anfinsen 原理：蛋白去折叠 →重新折叠 →生物学活性能够完全恢复，说明高级结构的信息蕴含在一级结构中。因此，设法以一级结构来推测高级结构具有理论上的可行性。 结构分析表明：有些蛋白之间具有很高的同源性，根据蛋白质结构和功能的高同源性关系预测未知蛋白质结构，在理论和实践上是可行的。 蛋白质结构预测——已有大量研究和成功实例，提供了实践上的可行性。 分子生物学和生物信息学等技术的发展，有可能直接从一