4.蛋白质的二级结构.docVIP

蛋白质的二级结构 2010遗传学 PartA 热动力学与蛋白质分子的构象 一种蛋白质自身所采取的构象或者功能状态取决于热动力学。（如典型的核糖核酸酶实验） 蛋白质的天然构象或者有功能的构象是由热力学规律控制的：酵素破坏氢键，巯基乙醇破坏二硫键 1 ）部分决定于多肽链氨基酸残基的局部分布; 2 ）在非局部构造特征折叠中，由重要的起主导的作用力决定。 作用力讲课顺序从强到弱 ?由于不同的静电作用，原子间的作用力影响蛋白分子中的每个原子表面势能、量子力、分子与周围溶剂（一般为水）的热力学性质 一、共价作用力 特点：蛋白质的原子之间共价作用力大于非共价力，之间的相互作用力是与各原子核之间的距离和键角有关的。 紧密接触（原子核相隔不到的范德华半径数值）未成键原子之间的复杂作用。。 非紧密接触 邻近电子间形成的键是局部构象参数主要的决定因素，并且未成键原子互相排斥力，是一个主要的对空间构象的局限。 二、静电作用力 包括： 1）带电基团之间相互作用； 2）偶极离子之间的相互作用 。 1、电荷间的相互作用 1 ）产生静电作用力的基团包括电荷间与偶极间的相互作用。电荷与电荷间的相互作用和ＱＱ1, /4πε0εrＱ2ε0 是真空电容率，ε 是溶液的电介质常数 这些力是长，但干和周围的高介电常数例如水溶离子大大减，表面，而不是点电荷，溶离子影响深，特别是多价离子;-