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血型分子诊断技术进展与应用
主要内容
红细胞血型系统分子诊断
红细胞血型系统分子基础
ABO血型系统
Rh血型系统
H血型系统(类孟买型)
红细胞血型系统分子诊断技术及其应用
小结
有关分子生物学概念
点突变
同义突变
无义突变
有义突变
起始密码突变
缺失
插入
重排
有关分子生物学概念
基因结构异常或表达异常
点突变
插入
缺失
易位和重排
拷贝数扩增
DNA多态性
基因的检测
常见突变示意图
ATG CGG TAG CGT AGT CTG
ATG CGA TAG CGT AGT CTG
ATA CGG TAG CGT AGT CTG
ATG CGGG TAG CGT AGT CTG
ATG CG TAG CGT AGT CTG
新等位基因形成
红细胞血型系统
40个基因
1250个等位基因(截止2012年5月12日)
参见Blood Group Antigen Gene Mutation Database
红细胞血型分子机制
点突变
同义突变、无义突变、 有义突变、起始密码突变、拼接接受位点
插入
缺失
基因重组(RHD/RHCE)
基因部分重复
/projects/gv/mhc/xslcgi.cgi?cmd=bgmut/systems
ABO血型分子生物学研究
1990年Yamamoto等首次克隆
基因定位于染色体9q34
ABO基因cDNA,其分子量为41,000 Dalton,DNA长度为1062bp
ABO血型系统为三复等位基因,有A、B、O三个基因
ABO基因包括7个外显子,长度大于18kb
大多数编码序列位于第6和7外显子
ABO基因示意图
常见等位基因
A和B基因 编码的蛋白都是353个氨基酸,O基因编码的蛋白只有 115个氨基酸
A101、A102、B101、O01、O02
A101作为参考序列
A102等位基因 C467T(Pro-Leu)
B101基因在297、526、657、703、796、803、930、1096位有8个核苷酸与A101基因不同
但只有526、703、796、803四个核苷酸的变化造成了氨基酸序列的变化(A101依次是精氨酸、甘氨酸、亮氨酸和甘氨酸,B101依次是甘氨酸、丝氨酸、蛋氨酸和丙氨酸)
O01基因在261位的G缺失,提前终止
ABO亚型频率分布
ABO血型中存在ABO亚型
临床输血和献血者检测中常见
440617份
A亚型22份
AxB 11例,AelB 3例,Ax 3例,Ael 2例,Amh 2例,A3 1例
B亚型41份
Bx11例,B39例,ABx7例,AB3 5例,Bel3例,Bm 2例,ABel 1例,ABend 1例,ABm 1例,Bend 1例。
B(A)1例
CisAB2例
A2 14例
A2B 35例
引自中国输血杂志2006,19(1):25
ABO亚型的分子研究
通过检测261、526、703、796、803位的核苷酸可以确认大多数典型的ABO血型的基因型
近年来对血清学分类的ABO血型亚型抗原,应用PCR、DNA测序等技术,在核苷酸和酶蛋白氨基酸序列水平上进行研究
结果表明:原为同一亚型的抗原存在异质性,即血清学上同一亚型,在核苷酸和酶蛋白氨基酸序列水平上有可能存在差异。
几个位点以外的核苷酸变化引起的ABO血型亚型常会引起检测结果的偏差
发现的等位基因数为290个(2012年05月22日)
A等位基因
可简要分为7大类等位基因
A1、A2、A3、Ax、Ael、Aw、Am
A101等位基因序列作为参照标准
A102(C467T)(在中国人群中比例大于A101)
A103(C467T,C564T)
A104(A297G)
A105(A297G,B-O1重组)
A106(B-O02重组)
A205(A1009G )
B等位基因型
可简要分为5大类等位基因
B1、B3、Bx、Bel、Bw
B等位基因中297、703、796、803位基本恒定
B101-B118
B101:A297G;C526G;C657T;G703A;C796A;G803C;G930A;G1096A
B301-B308
B301:A297G,C526G,C657T,G703A,C796A, G803C, G930A, G1096A, C1054T
O等位基因
O01-O74
大多数261nt缺失,13个261nt不缺失
O01:261delG
O02:261delG、T646A、G681T、C771T、G829A
人群中常见
003:261G、A297G,C526G,G802A
O50
CisAB和B(A)等位基因
CisAB01-06
CisAB01:C467T,G803C
CisAB02:C526G,C657T,G703A,G803C,
B(A)01-06
B(A)型单克隆试
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