- 1、本文档共51页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
次级代谢:构造单元与组装机制
Secondary Metabolism:
the Building Blocks and
Construction Mechanisms
本章内容
intermediary metabolism:中间代谢
metabolic pathway:代谢途径
primary metabolism:初级代谢
primary metabolites:初级代谢物
secondary metabolism :次级代谢
secondary metabolites :次级代谢物
2.1 初级代谢与次级代谢
术语学习:中间代谢与代谢途径
糖、蛋白质、核酸和脂类是生物体中最重要的分子
组成:多糖(糖单元)
蛋白质(氨基酸)
核酸(核苷酸)
Primary Metabolite
Primary metabolism(初级代谢):初级代谢过程是对维持植物生命活动不可缺少的过程,几乎所有绿色植物中都存在,包括葡萄糖、蛋白质、脂质、核酸等。涉及到的化合物为初级代谢物(Primary metabolites)
降解多糖和单糖途径:糖酵解和Krebs循环途径,同时通过有机物氧化释放能量
脂肪酸经b-氧化释放能量
Secondary metabolites(次级代谢):二次代谢过程是指并非在所有植物中都能发生,对维持植物生命活动来说又不起重要作用的过程。涉及到自然界中有限分布的化合物代谢。常见二代产物:生物碱、萜类化合物
产生大量的药理活性物质
次级和初级代谢界限区分并不严格
Secondary Metabolite
构造单元: Building Block
次级代谢产物的构造单元来自初级代谢过程
光合作用、糖酵解途径、Krebs循环提供生物合成中间体
除以上途径,氨基酸也是常见的构造单元,可构造肽类、蛋白质、生物碱以及抗生素等
更重要的是,次级代谢物不仅可由同一类型单元合成,也可由不同类型的构造单元合成,从而导致了天然产物结构多样性,当然,也复杂化了生物合成途径的分类
常见天然产物碳骨架和氮骨架
C1:一碳结构单元,通常是指甲基,来源于L-甲硫氨酸(L-methionine)。此外,二氧亚甲基也属于一碳结构单元
C2:二碳结构单元包括乙酰基或者链烃及芳香环中的一部分,来源于乙酰辅酶A(acetyl-CoA)。不过转变成二碳结构单元之前,乙酰辅酶A先转变成活性更高的丙二酰辅酶A(malonyl-CoA)
常见天然产物碳骨架和氮骨架
C5:支链的C5异戊二烯结构单元来源于甲羟戊酸(mevalonate)和磷酸脱氧木糖(deoxyxylu-lose phosphate)。
常见天然产物碳骨架和氮骨架
C6C3:苯丙素结构单元来源于,莽草酸途径产生的芳香族氨基酸L-苯丙氨酸或L-酪氨酸,它们脱去氨基形成苯丙素。C3还可裂解,产生C6C2和C6C1
常见天然产物碳骨架和氮骨架
C6C2N:该结构单元同样来源于L-苯丙氨酸或L-酪氨酸,它们脱去羧基形成该结构。
吲哚C2N:L-色氨酸脱羧基而成。
常见天然产物碳骨架和氮骨架
C4N:C4N结构单元通常出现在杂环吡咯环中,经非蛋白质氨基酸L-鸟氨酸脱去羧基和α-氨基N而成。
C5N:通常C5N出现于吡啶环中,来自于L-赖氨酸。
常见天然产物碳骨架和氮骨架
部分结构单元组装的化合物
组装机制
绝大多数天然产物一均由一系列酶催化反应而来,通常反应会涉及一些辅助因子,如NAD+,PLP, HSCoA。
酶催化反应优点:
特异性好
高效
温和
酶(催化剂)具有高度的立体选择性
组装机制
烃化反应:亲核取代
L-蛋氨酸经亲核取代提供C1结构单元
活性更高的 S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的形成(硫阳离子)
组装机制
烃化反应:亲核取代
2. SAM作用下的O-烃化、N-烃化和C-烃化
组装机制
烃化反应:亲核取代
二甲基烯丙基焦磷酸酯(DMAPP)作用下的烃化(C5结构单元异戊二烯)
组装机制
烃化反应:亲电加成
组装机制
烃化反应:亲电加成
1. 碳正离子的产生
2.碳正离子中质子的脱去
组装机制—重排
Wagner-Meerwein 重排
瓦格纳-梅尔外因重排反应是醇失水反应中,中间体碳正离子发生1,2-重排反应,并伴随有氢、烷基或芳基迁移的一类反应。这个反应普遍存在于很多萜类化合物中,其首次发现就是从异冰片转化为莰烯的反应得到的:
反应的推动力是由较不稳定的碳正离子重排为较稳定的碳正离子。碳正离子的稳定
文档评论(0)