基于R的群落学多元统计要点.pptVIP

1 基于 的群落多元统计分析 ——用vegan包进行排序分析 赖江山（janson) lai@ 中国科学院植物研究所 2010. 11.5 2 vegan软件包简介 3 vegan是Vegetation analysis的缩写,是群落分析的package 作者：Jari Oksanen /web/packages/vegan/index.html http://cc.oulu.fi/~jarioksa/softhelp/vegan.html library(vegan) 什么是排序(ordination)? 排序的过程是将样方或植物种排列在一定的空间，使得排序轴能够反映一定的生态梯度，从而，能够解释植被或植物种的分布与环境因子间的关系，也就是说排序是为了揭示植被-环境间的生态关系。因此，排序也叫梯度分析（gradient analysis）。 间接梯度分析 (Indirect gradient analysis) 直接梯度分析 (direct gradient analysis) 2个种的排序图 3个种的排序图 4个种的排序图？？？ 40个种排序图？？？ 排序的目标： 1.降低维数，减少坐标轴的数目 ； 2. 由降低维数引起的信息损失尽量少，即发生最小的畸变，也就是让新的坐标系第1-3轴排序轴包含大量的生态信息 。 排序的目的： 表示植被与环境之间的关